Protein–RNA interactions for Protein: P01008

SERPINC1, Antithrombin-III, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINC1P01008 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SERPINC1P01008 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SERPINC1P01008 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SERPINC1P01008 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SERPINC1P01008 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SERPINC1P01008 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SERPINC1P01008 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SERPINC1P01008 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SERPINC1P01008 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SERPINC1P01008 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SERPINC1P01008 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SERPINC1P01008 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SERPINC1P01008 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SERPINC1P01008 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SERPINC1P01008 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SERPINC1P01008 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SERPINC1P01008 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SERPINC1P01008 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SERPINC1P01008 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SERPINC1P01008 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SERPINC1P01008 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SERPINC1P01008 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SERPINC1P01008 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SERPINC1P01008 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SERPINC1P01008 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SERPINC1P01008 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SERPINC1P01008 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SERPINC1P01008 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SERPINC1P01008 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SERPINC1P01008 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SERPINC1P01008 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SERPINC1P01008 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SERPINC1P01008 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SERPINC1P01008 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SERPINC1P01008 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SERPINC1P01008 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SERPINC1P01008 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SERPINC1P01008 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SERPINC1P01008 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SERPINC1P01008 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SERPINC1P01008 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SERPINC1P01008 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SERPINC1P01008 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SERPINC1P01008 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SERPINC1P01008 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SERPINC1P01008 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SERPINC1P01008 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SERPINC1P01008 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SERPINC1P01008 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SERPINC1P01008 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SERPINC1P01008 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SERPINC1P01008 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SERPINC1P01008 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SERPINC1P01008 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SERPINC1P01008 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SERPINC1P01008 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SERPINC1P01008 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SERPINC1P01008 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SERPINC1P01008 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SERPINC1P01008 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SERPINC1P01008 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SERPINC1P01008 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SERPINC1P01008 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SERPINC1P01008 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SERPINC1P01008 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SERPINC1P01008 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SERPINC1P01008 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SERPINC1P01008 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SERPINC1P01008 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SERPINC1P01008 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SERPINC1P01008 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SERPINC1P01008 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SERPINC1P01008 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SERPINC1P01008 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SERPINC1P01008 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SERPINC1P01008 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SERPINC1P01008 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SERPINC1P01008 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SERPINC1P01008 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SERPINC1P01008 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SERPINC1P01008 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SERPINC1P01008 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SERPINC1P01008 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SERPINC1P01008 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SERPINC1P01008 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SERPINC1P01008 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SERPINC1P01008 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SERPINC1P01008 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SERPINC1P01008 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SERPINC1P01008 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SERPINC1P01008 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SERPINC1P01008 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SERPINC1P01008 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SERPINC1P01008 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SERPINC1P01008 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SERPINC1P01008 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SERPINC1P01008 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SERPINC1P01008 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SERPINC1P01008 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SERPINC1P01008 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms