Protein–RNA interactions for Protein: O95989

NUDT3, Diphosphoinositol polyphosphate phosphohydrolase 1, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDT3O95989 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUDT3O95989 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUDT3O95989 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUDT3O95989 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUDT3O95989 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUDT3O95989 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUDT3O95989 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUDT3O95989 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUDT3O95989 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUDT3O95989 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUDT3O95989 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUDT3O95989 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUDT3O95989 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUDT3O95989 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUDT3O95989 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUDT3O95989 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUDT3O95989 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NUDT3O95989 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUDT3O95989 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUDT3O95989 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUDT3O95989 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUDT3O95989 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUDT3O95989 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUDT3O95989 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUDT3O95989 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUDT3O95989 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUDT3O95989 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUDT3O95989 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUDT3O95989 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUDT3O95989 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUDT3O95989 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUDT3O95989 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUDT3O95989 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUDT3O95989 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUDT3O95989 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUDT3O95989 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUDT3O95989 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUDT3O95989 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUDT3O95989 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUDT3O95989 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUDT3O95989 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUDT3O95989 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUDT3O95989 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUDT3O95989 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUDT3O95989 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUDT3O95989 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUDT3O95989 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUDT3O95989 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUDT3O95989 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUDT3O95989 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUDT3O95989 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUDT3O95989 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUDT3O95989 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUDT3O95989 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUDT3O95989 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUDT3O95989 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUDT3O95989 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUDT3O95989 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUDT3O95989 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUDT3O95989 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUDT3O95989 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUDT3O95989 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUDT3O95989 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUDT3O95989 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUDT3O95989 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUDT3O95989 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NUDT3O95989 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NUDT3O95989 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NUDT3O95989 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NUDT3O95989 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NUDT3O95989 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NUDT3O95989 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NUDT3O95989 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NUDT3O95989 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NUDT3O95989 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NUDT3O95989 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NUDT3O95989 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NUDT3O95989 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NUDT3O95989 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NUDT3O95989 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NUDT3O95989 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NUDT3O95989 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NUDT3O95989 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NUDT3O95989 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NUDT3O95989 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NUDT3O95989 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NUDT3O95989 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NUDT3O95989 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NUDT3O95989 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NUDT3O95989 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NUDT3O95989 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NUDT3O95989 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NUDT3O95989 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NUDT3O95989 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NUDT3O95989 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NUDT3O95989 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
NUDT3O95989 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NUDT3O95989 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NUDT3O95989 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NUDT3O95989 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms