Protein–RNA interactions for Protein: O95926

SYF2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2O95926 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYF2O95926 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYF2O95926 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYF2O95926 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYF2O95926 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYF2O95926 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SYF2O95926 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SYF2O95926 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYF2O95926 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYF2O95926 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYF2O95926 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SYF2O95926 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SYF2O95926 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SYF2O95926 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SYF2O95926 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SYF2O95926 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SYF2O95926 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SYF2O95926 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SYF2O95926 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SYF2O95926 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SYF2O95926 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SYF2O95926 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
SYF2O95926 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SYF2O95926 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SYF2O95926 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SYF2O95926 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SYF2O95926 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SYF2O95926 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SYF2O95926 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SYF2O95926 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SYF2O95926 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SYF2O95926 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SYF2O95926 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SYF2O95926 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SYF2O95926 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SYF2O95926 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SYF2O95926 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SYF2O95926 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SYF2O95926 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SYF2O95926 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SYF2O95926 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SYF2O95926 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYF2O95926 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SYF2O95926 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYF2O95926 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYF2O95926 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYF2O95926 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYF2O95926 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYF2O95926 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYF2O95926 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYF2O95926 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYF2O95926 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYF2O95926 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYF2O95926 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYF2O95926 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYF2O95926 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYF2O95926 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYF2O95926 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYF2O95926 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYF2O95926 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYF2O95926 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYF2O95926 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYF2O95926 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYF2O95926 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYF2O95926 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYF2O95926 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYF2O95926 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYF2O95926 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYF2O95926 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYF2O95926 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SYF2O95926 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SYF2O95926 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYF2O95926 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYF2O95926 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYF2O95926 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYF2O95926 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYF2O95926 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYF2O95926 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYF2O95926 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYF2O95926 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYF2O95926 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYF2O95926 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYF2O95926 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYF2O95926 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYF2O95926 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYF2O95926 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYF2O95926 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYF2O95926 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYF2O95926 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SYF2O95926 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SYF2O95926 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYF2O95926 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYF2O95926 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYF2O95926 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYF2O95926 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYF2O95926 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYF2O95926 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYF2O95926 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYF2O95926 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYF2O95926 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms