Protein–RNA interactions for Protein: O95377

GJB5, Gap junction beta-5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB5O95377 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJB5O95377 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJB5O95377 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJB5O95377 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJB5O95377 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJB5O95377 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJB5O95377 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GJB5O95377 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJB5O95377 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJB5O95377 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJB5O95377 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJB5O95377 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJB5O95377 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GJB5O95377 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJB5O95377 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJB5O95377 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJB5O95377 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJB5O95377 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJB5O95377 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJB5O95377 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJB5O95377 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJB5O95377 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJB5O95377 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJB5O95377 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJB5O95377 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJB5O95377 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJB5O95377 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJB5O95377 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJB5O95377 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJB5O95377 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJB5O95377 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJB5O95377 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJB5O95377 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJB5O95377 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJB5O95377 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJB5O95377 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJB5O95377 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJB5O95377 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJB5O95377 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GJB5O95377 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJB5O95377 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJB5O95377 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJB5O95377 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJB5O95377 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJB5O95377 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJB5O95377 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJB5O95377 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJB5O95377 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJB5O95377 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJB5O95377 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GJB5O95377 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJB5O95377 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJB5O95377 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJB5O95377 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GJB5O95377 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJB5O95377 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GJB5O95377 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJB5O95377 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GJB5O95377 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJB5O95377 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJB5O95377 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJB5O95377 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJB5O95377 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJB5O95377 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJB5O95377 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJB5O95377 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJB5O95377 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJB5O95377 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJB5O95377 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJB5O95377 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJB5O95377 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJB5O95377 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJB5O95377 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJB5O95377 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJB5O95377 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJB5O95377 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJB5O95377 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GJB5O95377 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GJB5O95377 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GJB5O95377 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GJB5O95377 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GJB5O95377 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GJB5O95377 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GJB5O95377 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GJB5O95377 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GJB5O95377 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GJB5O95377 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GJB5O95377 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GJB5O95377 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GJB5O95377 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GJB5O95377 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GJB5O95377 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GJB5O95377 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GJB5O95377 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GJB5O95377 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GJB5O95377 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJB5O95377 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJB5O95377 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJB5O95377 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJB5O95377 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms