Protein–RNA interactions for Protein: O95295

SNAPIN, SNARE-associated protein Snapin, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPINO95295 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNAPINO95295 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SNAPINO95295 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNAPINO95295 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SNAPINO95295 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SNAPINO95295 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SNAPINO95295 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SNAPINO95295 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SNAPINO95295 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SNAPINO95295 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SNAPINO95295 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SNAPINO95295 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SNAPINO95295 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNAPINO95295 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNAPINO95295 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SNAPINO95295 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNAPINO95295 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNAPINO95295 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNAPINO95295 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNAPINO95295 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNAPINO95295 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNAPINO95295 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNAPINO95295 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNAPINO95295 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNAPINO95295 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNAPINO95295 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNAPINO95295 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNAPINO95295 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNAPINO95295 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNAPINO95295 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNAPINO95295 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNAPINO95295 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNAPINO95295 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNAPINO95295 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNAPINO95295 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNAPINO95295 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNAPINO95295 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNAPINO95295 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNAPINO95295 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNAPINO95295 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNAPINO95295 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNAPINO95295 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNAPINO95295 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNAPINO95295 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNAPINO95295 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNAPINO95295 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNAPINO95295 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNAPINO95295 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNAPINO95295 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNAPINO95295 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNAPINO95295 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNAPINO95295 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNAPINO95295 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNAPINO95295 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNAPINO95295 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNAPINO95295 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNAPINO95295 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNAPINO95295 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNAPINO95295 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNAPINO95295 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNAPINO95295 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNAPINO95295 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNAPINO95295 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNAPINO95295 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNAPINO95295 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SNAPINO95295 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNAPINO95295 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNAPINO95295 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNAPINO95295 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNAPINO95295 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNAPINO95295 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNAPINO95295 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNAPINO95295 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNAPINO95295 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNAPINO95295 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNAPINO95295 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNAPINO95295 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SNAPINO95295 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNAPINO95295 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNAPINO95295 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNAPINO95295 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNAPINO95295 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNAPINO95295 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNAPINO95295 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNAPINO95295 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNAPINO95295 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNAPINO95295 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNAPINO95295 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNAPINO95295 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNAPINO95295 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNAPINO95295 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNAPINO95295 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SNAPINO95295 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNAPINO95295 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNAPINO95295 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNAPINO95295 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNAPINO95295 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNAPINO95295 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNAPINO95295 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNAPINO95295 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms