Protein–RNA interactions for Protein: O95243

MBD4, Methyl-CpG-binding domain protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD4O95243 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MBD4O95243 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MBD4O95243 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MBD4O95243 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MBD4O95243 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MBD4O95243 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MBD4O95243 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MBD4O95243 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MBD4O95243 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MBD4O95243 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MBD4O95243 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
MBD4O95243 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MBD4O95243 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
MBD4O95243 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MBD4O95243 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
MBD4O95243 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MBD4O95243 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MBD4O95243 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MBD4O95243 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MBD4O95243 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MBD4O95243 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MBD4O95243 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MBD4O95243 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MBD4O95243 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
MBD4O95243 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MBD4O95243 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MBD4O95243 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MBD4O95243 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MBD4O95243 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MBD4O95243 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MBD4O95243 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MBD4O95243 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MBD4O95243 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MBD4O95243 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MBD4O95243 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MBD4O95243 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MBD4O95243 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MBD4O95243 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MBD4O95243 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
MBD4O95243 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MBD4O95243 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MBD4O95243 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MBD4O95243 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MBD4O95243 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MBD4O95243 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MBD4O95243 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MBD4O95243 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MBD4O95243 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MBD4O95243 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MBD4O95243 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MBD4O95243 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MBD4O95243 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MBD4O95243 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MBD4O95243 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MBD4O95243 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MBD4O95243 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MBD4O95243 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MBD4O95243 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MBD4O95243 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MBD4O95243 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MBD4O95243 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MBD4O95243 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MBD4O95243 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MBD4O95243 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MBD4O95243 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MBD4O95243 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MBD4O95243 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.51
MBD4O95243 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MBD4O95243 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MBD4O95243 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MBD4O95243 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MBD4O95243 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MBD4O95243 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MBD4O95243 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MBD4O95243 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MBD4O95243 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MBD4O95243 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MBD4O95243 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MBD4O95243 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MBD4O95243 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MBD4O95243 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MBD4O95243 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MBD4O95243 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MBD4O95243 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MBD4O95243 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MBD4O95243 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MBD4O95243 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MBD4O95243 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MBD4O95243 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MBD4O95243 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
MBD4O95243 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MBD4O95243 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MBD4O95243 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MBD4O95243 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
MBD4O95243 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MBD4O95243 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MBD4O95243 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MBD4O95243 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MBD4O95243 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MBD4O95243 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms