Protein–RNA interactions for Protein: O95210

STBD1, Starch-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STBD1O95210 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
STBD1O95210 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
STBD1O95210 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
STBD1O95210 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
STBD1O95210 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
STBD1O95210 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
STBD1O95210 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
STBD1O95210 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
STBD1O95210 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
STBD1O95210 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
STBD1O95210 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
STBD1O95210 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
STBD1O95210 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
STBD1O95210 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
STBD1O95210 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
STBD1O95210 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
STBD1O95210 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
STBD1O95210 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
STBD1O95210 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
STBD1O95210 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
STBD1O95210 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
STBD1O95210 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
STBD1O95210 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
STBD1O95210 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
STBD1O95210 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
STBD1O95210 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
STBD1O95210 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
STBD1O95210 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
STBD1O95210 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
STBD1O95210 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
STBD1O95210 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
STBD1O95210 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
STBD1O95210 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
STBD1O95210 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
STBD1O95210 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
STBD1O95210 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
STBD1O95210 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
STBD1O95210 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
STBD1O95210 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
STBD1O95210 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
STBD1O95210 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
STBD1O95210 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
STBD1O95210 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
STBD1O95210 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
STBD1O95210 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
STBD1O95210 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
STBD1O95210 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
STBD1O95210 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
STBD1O95210 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
STBD1O95210 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
STBD1O95210 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
STBD1O95210 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
STBD1O95210 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
STBD1O95210 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
STBD1O95210 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
STBD1O95210 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
STBD1O95210 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
STBD1O95210 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
STBD1O95210 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
STBD1O95210 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
STBD1O95210 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
STBD1O95210 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
STBD1O95210 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
STBD1O95210 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
STBD1O95210 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
STBD1O95210 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
STBD1O95210 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
STBD1O95210 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
STBD1O95210 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
STBD1O95210 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
STBD1O95210 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
STBD1O95210 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
STBD1O95210 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
STBD1O95210 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
STBD1O95210 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
STBD1O95210 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
STBD1O95210 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
STBD1O95210 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
STBD1O95210 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
STBD1O95210 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
STBD1O95210 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
STBD1O95210 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
STBD1O95210 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
STBD1O95210 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
STBD1O95210 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
STBD1O95210 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
STBD1O95210 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
STBD1O95210 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
STBD1O95210 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
STBD1O95210 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
STBD1O95210 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
STBD1O95210 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
STBD1O95210 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
STBD1O95210 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
STBD1O95210 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
STBD1O95210 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
STBD1O95210 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
STBD1O95210 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
STBD1O95210 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
STBD1O95210 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms