Protein–RNA interactions for Protein: O95045

UPP2, Uridine phosphorylase 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP2O95045 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UPP2O95045 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
UPP2O95045 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
UPP2O95045 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
UPP2O95045 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
UPP2O95045 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UPP2O95045 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UPP2O95045 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UPP2O95045 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UPP2O95045 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UPP2O95045 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UPP2O95045 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UPP2O95045 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UPP2O95045 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UPP2O95045 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UPP2O95045 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UPP2O95045 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UPP2O95045 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UPP2O95045 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UPP2O95045 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UPP2O95045 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UPP2O95045 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UPP2O95045 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UPP2O95045 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UPP2O95045 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UPP2O95045 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UPP2O95045 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UPP2O95045 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UPP2O95045 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UPP2O95045 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UPP2O95045 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UPP2O95045 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UPP2O95045 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UPP2O95045 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UPP2O95045 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UPP2O95045 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UPP2O95045 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UPP2O95045 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UPP2O95045 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UPP2O95045 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UPP2O95045 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UPP2O95045 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UPP2O95045 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
UPP2O95045 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UPP2O95045 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
UPP2O95045 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UPP2O95045 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UPP2O95045 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UPP2O95045 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UPP2O95045 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UPP2O95045 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UPP2O95045 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UPP2O95045 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UPP2O95045 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UPP2O95045 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UPP2O95045 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UPP2O95045 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UPP2O95045 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UPP2O95045 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UPP2O95045 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UPP2O95045 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UPP2O95045 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UPP2O95045 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
UPP2O95045 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UPP2O95045 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UPP2O95045 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UPP2O95045 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UPP2O95045 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UPP2O95045 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UPP2O95045 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UPP2O95045 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UPP2O95045 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UPP2O95045 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
UPP2O95045 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UPP2O95045 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UPP2O95045 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UPP2O95045 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UPP2O95045 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UPP2O95045 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UPP2O95045 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UPP2O95045 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UPP2O95045 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UPP2O95045 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UPP2O95045 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UPP2O95045 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UPP2O95045 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UPP2O95045 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UPP2O95045 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UPP2O95045 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
UPP2O95045 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UPP2O95045 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UPP2O95045 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UPP2O95045 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UPP2O95045 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UPP2O95045 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UPP2O95045 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UPP2O95045 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UPP2O95045 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UPP2O95045 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UPP2O95045 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms