Protein–RNA interactions for Protein: O94813

SLIT2, Slit homolog 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIT2O94813 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
SLIT2O94813 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLIT2O94813 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLIT2O94813 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLIT2O94813 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLIT2O94813 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLIT2O94813 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLIT2O94813 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLIT2O94813 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLIT2O94813 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLIT2O94813 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLIT2O94813 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLIT2O94813 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLIT2O94813 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
SLIT2O94813 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
SLIT2O94813 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLIT2O94813 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SLIT2O94813 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SLIT2O94813 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SLIT2O94813 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SLIT2O94813 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SLIT2O94813 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SLIT2O94813 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
SLIT2O94813 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SLIT2O94813 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SLIT2O94813 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SLIT2O94813 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SLIT2O94813 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SLIT2O94813 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
SLIT2O94813 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLIT2O94813 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLIT2O94813 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLIT2O94813 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLIT2O94813 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLIT2O94813 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLIT2O94813 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLIT2O94813 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLIT2O94813 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLIT2O94813 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLIT2O94813 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLIT2O94813 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLIT2O94813 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLIT2O94813 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
SLIT2O94813 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLIT2O94813 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLIT2O94813 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLIT2O94813 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLIT2O94813 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
SLIT2O94813 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SLIT2O94813 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SLIT2O94813 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SLIT2O94813 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SLIT2O94813 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SLIT2O94813 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SLIT2O94813 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SLIT2O94813 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SLIT2O94813 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLIT2O94813 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLIT2O94813 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLIT2O94813 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLIT2O94813 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLIT2O94813 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLIT2O94813 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLIT2O94813 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLIT2O94813 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLIT2O94813 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
SLIT2O94813 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
SLIT2O94813 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
SLIT2O94813 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
SLIT2O94813 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLIT2O94813 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLIT2O94813 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLIT2O94813 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLIT2O94813 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLIT2O94813 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLIT2O94813 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLIT2O94813 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
SLIT2O94813 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLIT2O94813 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLIT2O94813 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLIT2O94813 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLIT2O94813 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
SLIT2O94813 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLIT2O94813 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLIT2O94813 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLIT2O94813 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLIT2O94813 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLIT2O94813 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLIT2O94813 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLIT2O94813 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLIT2O94813 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLIT2O94813 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
SLIT2O94813 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLIT2O94813 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SLIT2O94813 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SLIT2O94813 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
SLIT2O94813 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SLIT2O94813 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SLIT2O94813 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SLIT2O94813 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms