Protein–RNA interactions for Protein: O94769

ECM2, Extracellular matrix protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM2O94769 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ECM2O94769 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ECM2O94769 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
ECM2O94769 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ECM2O94769 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ECM2O94769 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ECM2O94769 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ECM2O94769 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ECM2O94769 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ECM2O94769 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ECM2O94769 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ECM2O94769 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ECM2O94769 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ECM2O94769 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ECM2O94769 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ECM2O94769 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ECM2O94769 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ECM2O94769 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ECM2O94769 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ECM2O94769 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ECM2O94769 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ECM2O94769 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ECM2O94769 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ECM2O94769 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ECM2O94769 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ECM2O94769 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ECM2O94769 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ECM2O94769 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ECM2O94769 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ECM2O94769 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ECM2O94769 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ECM2O94769 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ECM2O94769 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ECM2O94769 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ECM2O94769 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ECM2O94769 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ECM2O94769 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ECM2O94769 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ECM2O94769 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ECM2O94769 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ECM2O94769 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ECM2O94769 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ECM2O94769 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ECM2O94769 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ECM2O94769 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ECM2O94769 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ECM2O94769 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ECM2O94769 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ECM2O94769 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ECM2O94769 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ECM2O94769 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ECM2O94769 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ECM2O94769 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ECM2O94769 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ECM2O94769 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ECM2O94769 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ECM2O94769 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ECM2O94769 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ECM2O94769 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ECM2O94769 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ECM2O94769 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ECM2O94769 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ECM2O94769 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ECM2O94769 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ECM2O94769 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ECM2O94769 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ECM2O94769 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ECM2O94769 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ECM2O94769 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ECM2O94769 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ECM2O94769 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ECM2O94769 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ECM2O94769 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ECM2O94769 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ECM2O94769 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ECM2O94769 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ECM2O94769 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ECM2O94769 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ECM2O94769 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ECM2O94769 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ECM2O94769 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ECM2O94769 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ECM2O94769 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ECM2O94769 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ECM2O94769 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ECM2O94769 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ECM2O94769 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ECM2O94769 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ECM2O94769 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ECM2O94769 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ECM2O94769 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ECM2O94769 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ECM2O94769 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ECM2O94769 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ECM2O94769 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ECM2O94769 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ECM2O94769 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ECM2O94769 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ECM2O94769 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ECM2O94769 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms