Protein–RNA interactions for Protein: O76071

CIAO1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIAO1O76071 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CIAO1O76071 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CIAO1O76071 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CIAO1O76071 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CIAO1O76071 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CIAO1O76071 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CIAO1O76071 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CIAO1O76071 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CIAO1O76071 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CIAO1O76071 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CIAO1O76071 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CIAO1O76071 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CIAO1O76071 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CIAO1O76071 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CIAO1O76071 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CIAO1O76071 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CIAO1O76071 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CIAO1O76071 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CIAO1O76071 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CIAO1O76071 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CIAO1O76071 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CIAO1O76071 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CIAO1O76071 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CIAO1O76071 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CIAO1O76071 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CIAO1O76071 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CIAO1O76071 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CIAO1O76071 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CIAO1O76071 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CIAO1O76071 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CIAO1O76071 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CIAO1O76071 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CIAO1O76071 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CIAO1O76071 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CIAO1O76071 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CIAO1O76071 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CIAO1O76071 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CIAO1O76071 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CIAO1O76071 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CIAO1O76071 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CIAO1O76071 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CIAO1O76071 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CIAO1O76071 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CIAO1O76071 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CIAO1O76071 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CIAO1O76071 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CIAO1O76071 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CIAO1O76071 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CIAO1O76071 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CIAO1O76071 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CIAO1O76071 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CIAO1O76071 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CIAO1O76071 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CIAO1O76071 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CIAO1O76071 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CIAO1O76071 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CIAO1O76071 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CIAO1O76071 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CIAO1O76071 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CIAO1O76071 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CIAO1O76071 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CIAO1O76071 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CIAO1O76071 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CIAO1O76071 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CIAO1O76071 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CIAO1O76071 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CIAO1O76071 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CIAO1O76071 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CIAO1O76071 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CIAO1O76071 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CIAO1O76071 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CIAO1O76071 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CIAO1O76071 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CIAO1O76071 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CIAO1O76071 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CIAO1O76071 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CIAO1O76071 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CIAO1O76071 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CIAO1O76071 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CIAO1O76071 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CIAO1O76071 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CIAO1O76071 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CIAO1O76071 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CIAO1O76071 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CIAO1O76071 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CIAO1O76071 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CIAO1O76071 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CIAO1O76071 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CIAO1O76071 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CIAO1O76071 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CIAO1O76071 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CIAO1O76071 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CIAO1O76071 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CIAO1O76071 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CIAO1O76071 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CIAO1O76071 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CIAO1O76071 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CIAO1O76071 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CIAO1O76071 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CIAO1O76071 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms