Protein–RNA interactions for Protein: O75676

RPS6KA4, Ribosomal protein S6 kinase alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KA4O75676 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RPS6KA4O75676 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RPS6KA4O75676 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RPS6KA4O75676 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RPS6KA4O75676 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RPS6KA4O75676 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RPS6KA4O75676 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RPS6KA4O75676 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RPS6KA4O75676 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RPS6KA4O75676 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RPS6KA4O75676 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RPS6KA4O75676 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RPS6KA4O75676 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RPS6KA4O75676 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RPS6KA4O75676 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RPS6KA4O75676 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RPS6KA4O75676 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RPS6KA4O75676 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RPS6KA4O75676 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RPS6KA4O75676 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RPS6KA4O75676 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
RPS6KA4O75676 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RPS6KA4O75676 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RPS6KA4O75676 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RPS6KA4O75676 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RPS6KA4O75676 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RPS6KA4O75676 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RPS6KA4O75676 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RPS6KA4O75676 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RPS6KA4O75676 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RPS6KA4O75676 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RPS6KA4O75676 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RPS6KA4O75676 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RPS6KA4O75676 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RPS6KA4O75676 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RPS6KA4O75676 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
RPS6KA4O75676 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
RPS6KA4O75676 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RPS6KA4O75676 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RPS6KA4O75676 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RPS6KA4O75676 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RPS6KA4O75676 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RPS6KA4O75676 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RPS6KA4O75676 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RPS6KA4O75676 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RPS6KA4O75676 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RPS6KA4O75676 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RPS6KA4O75676 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RPS6KA4O75676 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RPS6KA4O75676 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RPS6KA4O75676 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RPS6KA4O75676 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RPS6KA4O75676 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RPS6KA4O75676 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RPS6KA4O75676 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RPS6KA4O75676 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RPS6KA4O75676 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
RPS6KA4O75676 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RPS6KA4O75676 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RPS6KA4O75676 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RPS6KA4O75676 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RPS6KA4O75676 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RPS6KA4O75676 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RPS6KA4O75676 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RPS6KA4O75676 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RPS6KA4O75676 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RPS6KA4O75676 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RPS6KA4O75676 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RPS6KA4O75676 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RPS6KA4O75676 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RPS6KA4O75676 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RPS6KA4O75676 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RPS6KA4O75676 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RPS6KA4O75676 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RPS6KA4O75676 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RPS6KA4O75676 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RPS6KA4O75676 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RPS6KA4O75676 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RPS6KA4O75676 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RPS6KA4O75676 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RPS6KA4O75676 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RPS6KA4O75676 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RPS6KA4O75676 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RPS6KA4O75676 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RPS6KA4O75676 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RPS6KA4O75676 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RPS6KA4O75676 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RPS6KA4O75676 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RPS6KA4O75676 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RPS6KA4O75676 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RPS6KA4O75676 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RPS6KA4O75676 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RPS6KA4O75676 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RPS6KA4O75676 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RPS6KA4O75676 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RPS6KA4O75676 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
RPS6KA4O75676 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RPS6KA4O75676 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RPS6KA4O75676 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
RPS6KA4O75676 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms