Protein–RNA interactions for Protein: O75534

CSDE1, Cold shock domain-containing protein E1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSDE1O75534 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSDE1O75534 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSDE1O75534 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSDE1O75534 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSDE1O75534 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSDE1O75534 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSDE1O75534 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSDE1O75534 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSDE1O75534 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSDE1O75534 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSDE1O75534 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSDE1O75534 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CSDE1O75534 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CSDE1O75534 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSDE1O75534 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSDE1O75534 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CSDE1O75534 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSDE1O75534 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSDE1O75534 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSDE1O75534 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSDE1O75534 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSDE1O75534 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSDE1O75534 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSDE1O75534 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSDE1O75534 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSDE1O75534 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSDE1O75534 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSDE1O75534 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSDE1O75534 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSDE1O75534 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSDE1O75534 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSDE1O75534 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSDE1O75534 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSDE1O75534 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSDE1O75534 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSDE1O75534 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSDE1O75534 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
CSDE1O75534 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
CSDE1O75534 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSDE1O75534 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSDE1O75534 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSDE1O75534 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSDE1O75534 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSDE1O75534 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSDE1O75534 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSDE1O75534 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSDE1O75534 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSDE1O75534 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSDE1O75534 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSDE1O75534 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CSDE1O75534 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSDE1O75534 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSDE1O75534 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSDE1O75534 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSDE1O75534 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSDE1O75534 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSDE1O75534 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSDE1O75534 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSDE1O75534 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSDE1O75534 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSDE1O75534 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSDE1O75534 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSDE1O75534 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSDE1O75534 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSDE1O75534 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSDE1O75534 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSDE1O75534 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSDE1O75534 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSDE1O75534 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSDE1O75534 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSDE1O75534 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSDE1O75534 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSDE1O75534 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSDE1O75534 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSDE1O75534 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSDE1O75534 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CSDE1O75534 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSDE1O75534 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSDE1O75534 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSDE1O75534 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSDE1O75534 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CSDE1O75534 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSDE1O75534 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSDE1O75534 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSDE1O75534 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSDE1O75534 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSDE1O75534 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSDE1O75534 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSDE1O75534 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSDE1O75534 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSDE1O75534 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CSDE1O75534 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSDE1O75534 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSDE1O75534 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSDE1O75534 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSDE1O75534 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSDE1O75534 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSDE1O75534 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSDE1O75534 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSDE1O75534 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms