Protein–RNA interactions for Protein: O75473

LGR5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGR5O75473 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LGR5O75473 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LGR5O75473 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
LGR5O75473 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LGR5O75473 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LGR5O75473 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LGR5O75473 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LGR5O75473 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LGR5O75473 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LGR5O75473 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LGR5O75473 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LGR5O75473 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
LGR5O75473 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LGR5O75473 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LGR5O75473 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LGR5O75473 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LGR5O75473 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LGR5O75473 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LGR5O75473 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LGR5O75473 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LGR5O75473 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LGR5O75473 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LGR5O75473 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LGR5O75473 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LGR5O75473 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LGR5O75473 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
LGR5O75473 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LGR5O75473 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LGR5O75473 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
LGR5O75473 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LGR5O75473 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LGR5O75473 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LGR5O75473 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LGR5O75473 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LGR5O75473 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LGR5O75473 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LGR5O75473 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LGR5O75473 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LGR5O75473 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LGR5O75473 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LGR5O75473 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LGR5O75473 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LGR5O75473 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LGR5O75473 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LGR5O75473 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LGR5O75473 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LGR5O75473 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LGR5O75473 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
LGR5O75473 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LGR5O75473 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LGR5O75473 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
LGR5O75473 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LGR5O75473 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LGR5O75473 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LGR5O75473 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LGR5O75473 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LGR5O75473 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LGR5O75473 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LGR5O75473 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
LGR5O75473 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LGR5O75473 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LGR5O75473 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LGR5O75473 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LGR5O75473 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LGR5O75473 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LGR5O75473 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LGR5O75473 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LGR5O75473 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LGR5O75473 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LGR5O75473 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LGR5O75473 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LGR5O75473 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LGR5O75473 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LGR5O75473 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LGR5O75473 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LGR5O75473 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LGR5O75473 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LGR5O75473 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LGR5O75473 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LGR5O75473 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LGR5O75473 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LGR5O75473 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LGR5O75473 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LGR5O75473 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LGR5O75473 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LGR5O75473 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LGR5O75473 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LGR5O75473 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LGR5O75473 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LGR5O75473 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LGR5O75473 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LGR5O75473 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LGR5O75473 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
LGR5O75473 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LGR5O75473 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LGR5O75473 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LGR5O75473 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LGR5O75473 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LGR5O75473 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LGR5O75473 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms