Protein–RNA interactions for Protein: O75164

KDM4A, Lysine-specific demethylase 4A, humanhuman

Predictions only

Length 1,064 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4AO75164 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KDM4AO75164 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KDM4AO75164 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KDM4AO75164 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KDM4AO75164 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KDM4AO75164 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KDM4AO75164 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KDM4AO75164 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KDM4AO75164 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KDM4AO75164 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KDM4AO75164 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KDM4AO75164 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KDM4AO75164 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KDM4AO75164 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KDM4AO75164 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KDM4AO75164 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KDM4AO75164 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KDM4AO75164 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KDM4AO75164 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KDM4AO75164 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KDM4AO75164 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KDM4AO75164 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KDM4AO75164 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
KDM4AO75164 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KDM4AO75164 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KDM4AO75164 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
KDM4AO75164 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KDM4AO75164 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KDM4AO75164 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KDM4AO75164 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KDM4AO75164 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KDM4AO75164 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KDM4AO75164 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KDM4AO75164 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KDM4AO75164 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KDM4AO75164 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KDM4AO75164 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KDM4AO75164 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KDM4AO75164 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KDM4AO75164 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KDM4AO75164 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KDM4AO75164 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KDM4AO75164 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KDM4AO75164 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KDM4AO75164 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KDM4AO75164 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KDM4AO75164 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KDM4AO75164 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
KDM4AO75164 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KDM4AO75164 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KDM4AO75164 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KDM4AO75164 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KDM4AO75164 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
KDM4AO75164 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KDM4AO75164 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KDM4AO75164 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KDM4AO75164 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KDM4AO75164 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KDM4AO75164 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
KDM4AO75164 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KDM4AO75164 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KDM4AO75164 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KDM4AO75164 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KDM4AO75164 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KDM4AO75164 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KDM4AO75164 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KDM4AO75164 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KDM4AO75164 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KDM4AO75164 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
KDM4AO75164 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
KDM4AO75164 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KDM4AO75164 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
KDM4AO75164 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
KDM4AO75164 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KDM4AO75164 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KDM4AO75164 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KDM4AO75164 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KDM4AO75164 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KDM4AO75164 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KDM4AO75164 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KDM4AO75164 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KDM4AO75164 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KDM4AO75164 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KDM4AO75164 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KDM4AO75164 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
KDM4AO75164 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KDM4AO75164 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KDM4AO75164 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KDM4AO75164 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KDM4AO75164 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KDM4AO75164 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KDM4AO75164 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KDM4AO75164 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KDM4AO75164 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KDM4AO75164 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KDM4AO75164 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KDM4AO75164 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KDM4AO75164 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
KDM4AO75164 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KDM4AO75164 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms