Protein–RNA interactions for Protein: O60231

DHX16, Putative pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DHX16, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,041 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX16O60231 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DHX16O60231 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DHX16O60231 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DHX16O60231 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DHX16O60231 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DHX16O60231 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DHX16O60231 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DHX16O60231 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DHX16O60231 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DHX16O60231 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
DHX16O60231 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DHX16O60231 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
DHX16O60231 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DHX16O60231 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
DHX16O60231 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DHX16O60231 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
DHX16O60231 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DHX16O60231 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DHX16O60231 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DHX16O60231 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DHX16O60231 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DHX16O60231 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DHX16O60231 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
DHX16O60231 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DHX16O60231 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DHX16O60231 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DHX16O60231 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
DHX16O60231 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DHX16O60231 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DHX16O60231 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DHX16O60231 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
DHX16O60231 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DHX16O60231 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DHX16O60231 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DHX16O60231 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DHX16O60231 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DHX16O60231 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DHX16O60231 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DHX16O60231 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DHX16O60231 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DHX16O60231 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DHX16O60231 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
DHX16O60231 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
DHX16O60231 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DHX16O60231 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DHX16O60231 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DHX16O60231 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DHX16O60231 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DHX16O60231 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DHX16O60231 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DHX16O60231 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DHX16O60231 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DHX16O60231 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DHX16O60231 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DHX16O60231 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DHX16O60231 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DHX16O60231 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DHX16O60231 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DHX16O60231 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DHX16O60231 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
DHX16O60231 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
DHX16O60231 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
DHX16O60231 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DHX16O60231 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DHX16O60231 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DHX16O60231 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DHX16O60231 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DHX16O60231 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DHX16O60231 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DHX16O60231 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DHX16O60231 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DHX16O60231 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DHX16O60231 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DHX16O60231 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DHX16O60231 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DHX16O60231 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DHX16O60231 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DHX16O60231 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DHX16O60231 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DHX16O60231 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
DHX16O60231 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DHX16O60231 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DHX16O60231 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DHX16O60231 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DHX16O60231 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DHX16O60231 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DHX16O60231 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DHX16O60231 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
DHX16O60231 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
DHX16O60231 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
DHX16O60231 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
DHX16O60231 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
DHX16O60231 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
DHX16O60231 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DHX16O60231 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
DHX16O60231 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DHX16O60231 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
DHX16O60231 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DHX16O60231 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DHX16O60231 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms