Protein–RNA interactions for Protein: O43439

CBFA2T2, Protein CBFA2T2, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFA2T2O43439 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CBFA2T2O43439 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CBFA2T2O43439 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CBFA2T2O43439 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CBFA2T2O43439 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CBFA2T2O43439 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CBFA2T2O43439 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CBFA2T2O43439 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CBFA2T2O43439 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CBFA2T2O43439 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CBFA2T2O43439 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CBFA2T2O43439 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CBFA2T2O43439 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CBFA2T2O43439 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CBFA2T2O43439 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CBFA2T2O43439 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CBFA2T2O43439 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CBFA2T2O43439 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CBFA2T2O43439 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CBFA2T2O43439 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CBFA2T2O43439 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CBFA2T2O43439 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CBFA2T2O43439 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CBFA2T2O43439 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CBFA2T2O43439 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CBFA2T2O43439 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CBFA2T2O43439 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CBFA2T2O43439 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CBFA2T2O43439 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CBFA2T2O43439 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CBFA2T2O43439 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CBFA2T2O43439 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CBFA2T2O43439 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CBFA2T2O43439 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CBFA2T2O43439 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CBFA2T2O43439 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CBFA2T2O43439 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CBFA2T2O43439 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CBFA2T2O43439 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CBFA2T2O43439 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CBFA2T2O43439 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CBFA2T2O43439 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CBFA2T2O43439 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CBFA2T2O43439 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CBFA2T2O43439 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CBFA2T2O43439 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CBFA2T2O43439 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CBFA2T2O43439 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CBFA2T2O43439 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CBFA2T2O43439 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CBFA2T2O43439 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CBFA2T2O43439 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CBFA2T2O43439 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CBFA2T2O43439 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CBFA2T2O43439 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CBFA2T2O43439 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CBFA2T2O43439 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CBFA2T2O43439 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CBFA2T2O43439 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CBFA2T2O43439 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CBFA2T2O43439 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CBFA2T2O43439 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CBFA2T2O43439 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CBFA2T2O43439 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CBFA2T2O43439 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CBFA2T2O43439 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CBFA2T2O43439 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CBFA2T2O43439 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CBFA2T2O43439 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CBFA2T2O43439 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CBFA2T2O43439 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CBFA2T2O43439 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CBFA2T2O43439 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CBFA2T2O43439 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CBFA2T2O43439 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CBFA2T2O43439 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CBFA2T2O43439 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CBFA2T2O43439 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CBFA2T2O43439 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CBFA2T2O43439 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CBFA2T2O43439 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CBFA2T2O43439 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CBFA2T2O43439 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CBFA2T2O43439 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CBFA2T2O43439 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CBFA2T2O43439 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CBFA2T2O43439 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CBFA2T2O43439 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CBFA2T2O43439 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CBFA2T2O43439 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CBFA2T2O43439 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CBFA2T2O43439 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CBFA2T2O43439 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CBFA2T2O43439 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CBFA2T2O43439 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CBFA2T2O43439 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CBFA2T2O43439 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CBFA2T2O43439 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CBFA2T2O43439 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CBFA2T2O43439 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms