Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXA2O43364 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXA2O43364 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXA2O43364 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXA2O43364 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXA2O43364 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXA2O43364 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXA2O43364 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXA2O43364 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXA2O43364 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXA2O43364 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXA2O43364 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXA2O43364 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXA2O43364 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXA2O43364 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXA2O43364 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXA2O43364 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXA2O43364 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXA2O43364 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXA2O43364 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXA2O43364 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXA2O43364 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXA2O43364 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXA2O43364 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXA2O43364 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXA2O43364 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXA2O43364 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXA2O43364 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXA2O43364 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXA2O43364 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXA2O43364 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXA2O43364 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXA2O43364 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXA2O43364 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXA2O43364 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXA2O43364 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXA2O43364 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXA2O43364 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXA2O43364 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXA2O43364 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXA2O43364 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXA2O43364 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXA2O43364 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXA2O43364 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXA2O43364 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXA2O43364 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXA2O43364 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXA2O43364 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXA2O43364 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXA2O43364 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXA2O43364 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXA2O43364 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXA2O43364 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXA2O43364 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXA2O43364 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXA2O43364 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXA2O43364 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXA2O43364 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXA2O43364 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXA2O43364 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXA2O43364 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXA2O43364 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXA2O43364 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXA2O43364 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXA2O43364 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXA2O43364 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXA2O43364 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXA2O43364 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXA2O43364 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXA2O43364 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXA2O43364 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXA2O43364 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXA2O43364 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXA2O43364 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXA2O43364 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXA2O43364 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXA2O43364 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXA2O43364 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXA2O43364 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXA2O43364 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXA2O43364 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXA2O43364 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXA2O43364 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXA2O43364 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXA2O43364 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXA2O43364 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXA2O43364 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXA2O43364 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXA2O43364 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXA2O43364 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXA2O43364 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXA2O43364 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXA2O43364 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXA2O43364 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXA2O43364 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXA2O43364 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXA2O43364 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXA2O43364 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXA2O43364 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXA2O43364 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms