Protein–RNA interactions for Protein: O43237

DYNC1LI2, Cytoplasmic dynein 1 light intermediate chain 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DYNC1LI2O43237 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DYNC1LI2O43237 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DYNC1LI2O43237 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DYNC1LI2O43237 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DYNC1LI2O43237 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DYNC1LI2O43237 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DYNC1LI2O43237 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DYNC1LI2O43237 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DYNC1LI2O43237 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DYNC1LI2O43237 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
DYNC1LI2O43237 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DYNC1LI2O43237 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
DYNC1LI2O43237 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DYNC1LI2O43237 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
DYNC1LI2O43237 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DYNC1LI2O43237 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DYNC1LI2O43237 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DYNC1LI2O43237 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DYNC1LI2O43237 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DYNC1LI2O43237 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DYNC1LI2O43237 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DYNC1LI2O43237 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DYNC1LI2O43237 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DYNC1LI2O43237 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DYNC1LI2O43237 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DYNC1LI2O43237 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DYNC1LI2O43237 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DYNC1LI2O43237 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DYNC1LI2O43237 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
DYNC1LI2O43237 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DYNC1LI2O43237 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DYNC1LI2O43237 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DYNC1LI2O43237 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DYNC1LI2O43237 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DYNC1LI2O43237 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DYNC1LI2O43237 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DYNC1LI2O43237 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DYNC1LI2O43237 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.27
DYNC1LI2O43237 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DYNC1LI2O43237 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DYNC1LI2O43237 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DYNC1LI2O43237 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DYNC1LI2O43237 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
DYNC1LI2O43237 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DYNC1LI2O43237 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
DYNC1LI2O43237 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DYNC1LI2O43237 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DYNC1LI2O43237 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DYNC1LI2O43237 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DYNC1LI2O43237 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DYNC1LI2O43237 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DYNC1LI2O43237 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DYNC1LI2O43237 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DYNC1LI2O43237 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DYNC1LI2O43237 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DYNC1LI2O43237 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
DYNC1LI2O43237 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DYNC1LI2O43237 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DYNC1LI2O43237 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DYNC1LI2O43237 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DYNC1LI2O43237 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DYNC1LI2O43237 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DYNC1LI2O43237 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DYNC1LI2O43237 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DYNC1LI2O43237 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DYNC1LI2O43237 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DYNC1LI2O43237 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DYNC1LI2O43237 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DYNC1LI2O43237 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DYNC1LI2O43237 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DYNC1LI2O43237 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DYNC1LI2O43237 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DYNC1LI2O43237 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DYNC1LI2O43237 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DYNC1LI2O43237 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DYNC1LI2O43237 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DYNC1LI2O43237 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
DYNC1LI2O43237 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DYNC1LI2O43237 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DYNC1LI2O43237 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
DYNC1LI2O43237 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DYNC1LI2O43237 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
DYNC1LI2O43237 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DYNC1LI2O43237 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DYNC1LI2O43237 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DYNC1LI2O43237 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DYNC1LI2O43237 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DYNC1LI2O43237 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DYNC1LI2O43237 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DYNC1LI2O43237 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DYNC1LI2O43237 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DYNC1LI2O43237 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DYNC1LI2O43237 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DYNC1LI2O43237 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DYNC1LI2O43237 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DYNC1LI2O43237 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
DYNC1LI2O43237 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DYNC1LI2O43237 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DYNC1LI2O43237 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DYNC1LI2O43237 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms