Protein–RNA interactions for Protein: O43147

SGSM2, Small G protein signaling modulator 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,006 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM2O43147 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SGSM2O43147 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SGSM2O43147 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SGSM2O43147 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SGSM2O43147 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SGSM2O43147 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SGSM2O43147 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SGSM2O43147 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SGSM2O43147 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SGSM2O43147 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SGSM2O43147 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SGSM2O43147 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SGSM2O43147 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SGSM2O43147 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SGSM2O43147 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SGSM2O43147 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SGSM2O43147 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SGSM2O43147 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SGSM2O43147 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SGSM2O43147 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SGSM2O43147 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SGSM2O43147 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SGSM2O43147 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SGSM2O43147 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SGSM2O43147 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SGSM2O43147 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SGSM2O43147 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SGSM2O43147 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SGSM2O43147 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SGSM2O43147 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SGSM2O43147 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SGSM2O43147 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SGSM2O43147 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SGSM2O43147 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SGSM2O43147 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SGSM2O43147 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SGSM2O43147 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SGSM2O43147 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SGSM2O43147 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SGSM2O43147 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SGSM2O43147 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SGSM2O43147 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SGSM2O43147 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SGSM2O43147 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SGSM2O43147 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SGSM2O43147 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SGSM2O43147 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SGSM2O43147 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SGSM2O43147 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SGSM2O43147 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SGSM2O43147 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SGSM2O43147 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SGSM2O43147 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SGSM2O43147 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SGSM2O43147 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SGSM2O43147 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SGSM2O43147 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SGSM2O43147 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SGSM2O43147 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SGSM2O43147 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SGSM2O43147 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SGSM2O43147 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SGSM2O43147 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SGSM2O43147 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
SGSM2O43147 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SGSM2O43147 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SGSM2O43147 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SGSM2O43147 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SGSM2O43147 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SGSM2O43147 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SGSM2O43147 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SGSM2O43147 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SGSM2O43147 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SGSM2O43147 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SGSM2O43147 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SGSM2O43147 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SGSM2O43147 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SGSM2O43147 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SGSM2O43147 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SGSM2O43147 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SGSM2O43147 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SGSM2O43147 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SGSM2O43147 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SGSM2O43147 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SGSM2O43147 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SGSM2O43147 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SGSM2O43147 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SGSM2O43147 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SGSM2O43147 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SGSM2O43147 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SGSM2O43147 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SGSM2O43147 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SGSM2O43147 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SGSM2O43147 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SGSM2O43147 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SGSM2O43147 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SGSM2O43147 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SGSM2O43147 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SGSM2O43147 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SGSM2O43147 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms