Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EBAG9O00559 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
EBAG9O00559 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EBAG9O00559 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
EBAG9O00559 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EBAG9O00559 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EBAG9O00559 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EBAG9O00559 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EBAG9O00559 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EBAG9O00559 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EBAG9O00559 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EBAG9O00559 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
EBAG9O00559 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EBAG9O00559 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
EBAG9O00559 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EBAG9O00559 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
EBAG9O00559 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EBAG9O00559 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
EBAG9O00559 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EBAG9O00559 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EBAG9O00559 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EBAG9O00559 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
EBAG9O00559 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
EBAG9O00559 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
EBAG9O00559 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
EBAG9O00559 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
EBAG9O00559 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
EBAG9O00559 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EBAG9O00559 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EBAG9O00559 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EBAG9O00559 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
EBAG9O00559 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
EBAG9O00559 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
EBAG9O00559 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
EBAG9O00559 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EBAG9O00559 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
EBAG9O00559 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
EBAG9O00559 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EBAG9O00559 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EBAG9O00559 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EBAG9O00559 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EBAG9O00559 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EBAG9O00559 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EBAG9O00559 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EBAG9O00559 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EBAG9O00559 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EBAG9O00559 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EBAG9O00559 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EBAG9O00559 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EBAG9O00559 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EBAG9O00559 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EBAG9O00559 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EBAG9O00559 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EBAG9O00559 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EBAG9O00559 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
EBAG9O00559 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EBAG9O00559 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EBAG9O00559 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EBAG9O00559 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EBAG9O00559 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EBAG9O00559 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
EBAG9O00559 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EBAG9O00559 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
EBAG9O00559 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
EBAG9O00559 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EBAG9O00559 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EBAG9O00559 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EBAG9O00559 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
EBAG9O00559 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
EBAG9O00559 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EBAG9O00559 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EBAG9O00559 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EBAG9O00559 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EBAG9O00559 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EBAG9O00559 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
EBAG9O00559 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EBAG9O00559 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
EBAG9O00559 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.87
EBAG9O00559 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
EBAG9O00559 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EBAG9O00559 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EBAG9O00559 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
EBAG9O00559 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EBAG9O00559 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EBAG9O00559 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EBAG9O00559 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EBAG9O00559 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EBAG9O00559 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EBAG9O00559 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EBAG9O00559 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EBAG9O00559 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EBAG9O00559 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EBAG9O00559 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EBAG9O00559 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EBAG9O00559 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EBAG9O00559 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EBAG9O00559 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EBAG9O00559 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EBAG9O00559 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EBAG9O00559 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms