Protein–RNA interactions for Protein: H3BVE0

BOLA2-SMG1P6, BOLA2-SMG1P6 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.46
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms