Protein–RNA interactions for Protein: H3BPF8

GOLGA8S, Golgin A8 family member S, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8SH3BPF8 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GOLGA8SH3BPF8 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GOLGA8SH3BPF8 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
GOLGA8SH3BPF8 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
GOLGA8SH3BPF8 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GOLGA8SH3BPF8 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GOLGA8SH3BPF8 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GOLGA8SH3BPF8 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GOLGA8SH3BPF8 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GOLGA8SH3BPF8 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GOLGA8SH3BPF8 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GOLGA8SH3BPF8 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GOLGA8SH3BPF8 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
GOLGA8SH3BPF8 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GOLGA8SH3BPF8 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GOLGA8SH3BPF8 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GOLGA8SH3BPF8 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GOLGA8SH3BPF8 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GOLGA8SH3BPF8 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GOLGA8SH3BPF8 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GOLGA8SH3BPF8 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GOLGA8SH3BPF8 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GOLGA8SH3BPF8 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GOLGA8SH3BPF8 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GOLGA8SH3BPF8 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GOLGA8SH3BPF8 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GOLGA8SH3BPF8 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GOLGA8SH3BPF8 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GOLGA8SH3BPF8 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GOLGA8SH3BPF8 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GOLGA8SH3BPF8 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GOLGA8SH3BPF8 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GOLGA8SH3BPF8 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GOLGA8SH3BPF8 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GOLGA8SH3BPF8 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
GOLGA8SH3BPF8 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GOLGA8SH3BPF8 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GOLGA8SH3BPF8 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GOLGA8SH3BPF8 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GOLGA8SH3BPF8 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GOLGA8SH3BPF8 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
GOLGA8SH3BPF8 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GOLGA8SH3BPF8 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GOLGA8SH3BPF8 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GOLGA8SH3BPF8 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GOLGA8SH3BPF8 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GOLGA8SH3BPF8 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GOLGA8SH3BPF8 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
GOLGA8SH3BPF8 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GOLGA8SH3BPF8 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GOLGA8SH3BPF8 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GOLGA8SH3BPF8 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GOLGA8SH3BPF8 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GOLGA8SH3BPF8 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GOLGA8SH3BPF8 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GOLGA8SH3BPF8 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GOLGA8SH3BPF8 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GOLGA8SH3BPF8 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GOLGA8SH3BPF8 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GOLGA8SH3BPF8 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GOLGA8SH3BPF8 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GOLGA8SH3BPF8 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GOLGA8SH3BPF8 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GOLGA8SH3BPF8 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GOLGA8SH3BPF8 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
GOLGA8SH3BPF8 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GOLGA8SH3BPF8 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GOLGA8SH3BPF8 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GOLGA8SH3BPF8 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GOLGA8SH3BPF8 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GOLGA8SH3BPF8 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GOLGA8SH3BPF8 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GOLGA8SH3BPF8 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GOLGA8SH3BPF8 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GOLGA8SH3BPF8 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GOLGA8SH3BPF8 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GOLGA8SH3BPF8 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GOLGA8SH3BPF8 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GOLGA8SH3BPF8 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GOLGA8SH3BPF8 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GOLGA8SH3BPF8 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GOLGA8SH3BPF8 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GOLGA8SH3BPF8 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GOLGA8SH3BPF8 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
GOLGA8SH3BPF8 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GOLGA8SH3BPF8 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
GOLGA8SH3BPF8 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GOLGA8SH3BPF8 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GOLGA8SH3BPF8 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GOLGA8SH3BPF8 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GOLGA8SH3BPF8 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GOLGA8SH3BPF8 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GOLGA8SH3BPF8 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GOLGA8SH3BPF8 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GOLGA8SH3BPF8 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GOLGA8SH3BPF8 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GOLGA8SH3BPF8 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GOLGA8SH3BPF8 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GOLGA8SH3BPF8 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GOLGA8SH3BPF8 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms