Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NEDD8-MDP1E9PL57 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NEDD8-MDP1E9PL57 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NEDD8-MDP1E9PL57 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NEDD8-MDP1E9PL57 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NEDD8-MDP1E9PL57 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NEDD8-MDP1E9PL57 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NEDD8-MDP1E9PL57 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NEDD8-MDP1E9PL57 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NEDD8-MDP1E9PL57 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NEDD8-MDP1E9PL57 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NEDD8-MDP1E9PL57 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NEDD8-MDP1E9PL57 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NEDD8-MDP1E9PL57 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NEDD8-MDP1E9PL57 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NEDD8-MDP1E9PL57 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NEDD8-MDP1E9PL57 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NEDD8-MDP1E9PL57 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NEDD8-MDP1E9PL57 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NEDD8-MDP1E9PL57 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NEDD8-MDP1E9PL57 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NEDD8-MDP1E9PL57 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NEDD8-MDP1E9PL57 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
NEDD8-MDP1E9PL57 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NEDD8-MDP1E9PL57 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NEDD8-MDP1E9PL57 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NEDD8-MDP1E9PL57 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NEDD8-MDP1E9PL57 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NEDD8-MDP1E9PL57 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NEDD8-MDP1E9PL57 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NEDD8-MDP1E9PL57 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NEDD8-MDP1E9PL57 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NEDD8-MDP1E9PL57 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NEDD8-MDP1E9PL57 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NEDD8-MDP1E9PL57 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NEDD8-MDP1E9PL57 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
NEDD8-MDP1E9PL57 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NEDD8-MDP1E9PL57 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NEDD8-MDP1E9PL57 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NEDD8-MDP1E9PL57 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NEDD8-MDP1E9PL57 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
NEDD8-MDP1E9PL57 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NEDD8-MDP1E9PL57 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NEDD8-MDP1E9PL57 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
NEDD8-MDP1E9PL57 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NEDD8-MDP1E9PL57 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NEDD8-MDP1E9PL57 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NEDD8-MDP1E9PL57 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NEDD8-MDP1E9PL57 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NEDD8-MDP1E9PL57 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NEDD8-MDP1E9PL57 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NEDD8-MDP1E9PL57 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NEDD8-MDP1E9PL57 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NEDD8-MDP1E9PL57 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NEDD8-MDP1E9PL57 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NEDD8-MDP1E9PL57 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
NEDD8-MDP1E9PL57 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
NEDD8-MDP1E9PL57 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NEDD8-MDP1E9PL57 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NEDD8-MDP1E9PL57 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NEDD8-MDP1E9PL57 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NEDD8-MDP1E9PL57 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NEDD8-MDP1E9PL57 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NEDD8-MDP1E9PL57 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NEDD8-MDP1E9PL57 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NEDD8-MDP1E9PL57 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NEDD8-MDP1E9PL57 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NEDD8-MDP1E9PL57 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NEDD8-MDP1E9PL57 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
NEDD8-MDP1E9PL57 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
NEDD8-MDP1E9PL57 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NEDD8-MDP1E9PL57 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
NEDD8-MDP1E9PL57 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NEDD8-MDP1E9PL57 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
NEDD8-MDP1E9PL57 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC21■□□□□ 0.95
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NEDD8-MDP1E9PL57 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
NEDD8-MDP1E9PL57 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NEDD8-MDP1E9PL57 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
NEDD8-MDP1E9PL57 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NEDD8-MDP1E9PL57 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NEDD8-MDP1E9PL57 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NEDD8-MDP1E9PL57 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
NEDD8-MDP1E9PL57 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NEDD8-MDP1E9PL57 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NEDD8-MDP1E9PL57 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NEDD8-MDP1E9PL57 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NEDD8-MDP1E9PL57 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NEDD8-MDP1E9PL57 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NEDD8-MDP1E9PL57 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NEDD8-MDP1E9PL57 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NEDD8-MDP1E9PL57 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
NEDD8-MDP1E9PL57 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NEDD8-MDP1E9PL57 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NEDD8-MDP1E9PL57 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
NEDD8-MDP1E9PL57 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
NEDD8-MDP1E9PL57 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NEDD8-MDP1E9PL57 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NEDD8-MDP1E9PL57 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms