Protein–RNA interactions for Protein: C9JLJ4

USP17L13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L13C9JLJ4 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP17L13C9JLJ4 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP17L13C9JLJ4 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP17L13C9JLJ4 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP17L13C9JLJ4 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP17L13C9JLJ4 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP17L13C9JLJ4 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP17L13C9JLJ4 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP17L13C9JLJ4 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP17L13C9JLJ4 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP17L13C9JLJ4 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP17L13C9JLJ4 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP17L13C9JLJ4 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP17L13C9JLJ4 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP17L13C9JLJ4 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP17L13C9JLJ4 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP17L13C9JLJ4 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP17L13C9JLJ4 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
USP17L13C9JLJ4 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
USP17L13C9JLJ4 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP17L13C9JLJ4 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP17L13C9JLJ4 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP17L13C9JLJ4 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP17L13C9JLJ4 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP17L13C9JLJ4 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP17L13C9JLJ4 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP17L13C9JLJ4 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP17L13C9JLJ4 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP17L13C9JLJ4 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP17L13C9JLJ4 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP17L13C9JLJ4 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP17L13C9JLJ4 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP17L13C9JLJ4 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP17L13C9JLJ4 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP17L13C9JLJ4 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP17L13C9JLJ4 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP17L13C9JLJ4 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP17L13C9JLJ4 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP17L13C9JLJ4 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP17L13C9JLJ4 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
USP17L13C9JLJ4 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP17L13C9JLJ4 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP17L13C9JLJ4 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
USP17L13C9JLJ4 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP17L13C9JLJ4 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP17L13C9JLJ4 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP17L13C9JLJ4 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP17L13C9JLJ4 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
USP17L13C9JLJ4 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
USP17L13C9JLJ4 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
USP17L13C9JLJ4 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
USP17L13C9JLJ4 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
USP17L13C9JLJ4 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP17L13C9JLJ4 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP17L13C9JLJ4 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP17L13C9JLJ4 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
USP17L13C9JLJ4 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
USP17L13C9JLJ4 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP17L13C9JLJ4 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP17L13C9JLJ4 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP17L13C9JLJ4 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP17L13C9JLJ4 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP17L13C9JLJ4 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP17L13C9JLJ4 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP17L13C9JLJ4 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP17L13C9JLJ4 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP17L13C9JLJ4 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP17L13C9JLJ4 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP17L13C9JLJ4 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP17L13C9JLJ4 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP17L13C9JLJ4 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP17L13C9JLJ4 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP17L13C9JLJ4 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
USP17L13C9JLJ4 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP17L13C9JLJ4 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP17L13C9JLJ4 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP17L13C9JLJ4 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP17L13C9JLJ4 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP17L13C9JLJ4 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP17L13C9JLJ4 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP17L13C9JLJ4 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP17L13C9JLJ4 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP17L13C9JLJ4 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP17L13C9JLJ4 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP17L13C9JLJ4 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP17L13C9JLJ4 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP17L13C9JLJ4 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP17L13C9JLJ4 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP17L13C9JLJ4 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP17L13C9JLJ4 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP17L13C9JLJ4 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP17L13C9JLJ4 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
USP17L13C9JLJ4 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP17L13C9JLJ4 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP17L13C9JLJ4 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP17L13C9JLJ4 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP17L13C9JLJ4 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP17L13C9JLJ4 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP17L13C9JLJ4 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP17L13C9JLJ4 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms