Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ERVV-2B6SEH9 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ERVV-2B6SEH9 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ERVV-2B6SEH9 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ERVV-2B6SEH9 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ERVV-2B6SEH9 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ERVV-2B6SEH9 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ERVV-2B6SEH9 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ERVV-2B6SEH9 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ERVV-2B6SEH9 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ERVV-2B6SEH9 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ERVV-2B6SEH9 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ERVV-2B6SEH9 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ERVV-2B6SEH9 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ERVV-2B6SEH9 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ERVV-2B6SEH9 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ERVV-2B6SEH9 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ERVV-2B6SEH9 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ERVV-2B6SEH9 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ERVV-2B6SEH9 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
ERVV-2B6SEH9 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ERVV-2B6SEH9 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ERVV-2B6SEH9 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ERVV-2B6SEH9 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ERVV-2B6SEH9 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ERVV-2B6SEH9 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ERVV-2B6SEH9 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ERVV-2B6SEH9 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ERVV-2B6SEH9 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ERVV-2B6SEH9 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ERVV-2B6SEH9 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ERVV-2B6SEH9 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ERVV-2B6SEH9 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ERVV-2B6SEH9 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ERVV-2B6SEH9 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ERVV-2B6SEH9 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ERVV-2B6SEH9 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ERVV-2B6SEH9 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ERVV-2B6SEH9 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ERVV-2B6SEH9 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ERVV-2B6SEH9 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ERVV-2B6SEH9 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ERVV-2B6SEH9 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
ERVV-2B6SEH9 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ERVV-2B6SEH9 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ERVV-2B6SEH9 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ERVV-2B6SEH9 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ERVV-2B6SEH9 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ERVV-2B6SEH9 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ERVV-2B6SEH9 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ERVV-2B6SEH9 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ERVV-2B6SEH9 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
ERVV-2B6SEH9 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ERVV-2B6SEH9 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ERVV-2B6SEH9 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ERVV-2B6SEH9 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ERVV-2B6SEH9 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ERVV-2B6SEH9 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ERVV-2B6SEH9 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ERVV-2B6SEH9 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ERVV-2B6SEH9 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
ERVV-2B6SEH9 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
ERVV-2B6SEH9 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ERVV-2B6SEH9 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ERVV-2B6SEH9 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ERVV-2B6SEH9 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ERVV-2B6SEH9 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ERVV-2B6SEH9 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
ERVV-2B6SEH9 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ERVV-2B6SEH9 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ERVV-2B6SEH9 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ERVV-2B6SEH9 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ERVV-2B6SEH9 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ERVV-2B6SEH9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ERVV-2B6SEH9 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ERVV-2B6SEH9 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ERVV-2B6SEH9 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ERVV-2B6SEH9 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ERVV-2B6SEH9 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ERVV-2B6SEH9 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ERVV-2B6SEH9 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
ERVV-2B6SEH9 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ERVV-2B6SEH9 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ERVV-2B6SEH9 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ERVV-2B6SEH9 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ERVV-2B6SEH9 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ERVV-2B6SEH9 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ERVV-2B6SEH9 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ERVV-2B6SEH9 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ERVV-2B6SEH9 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ERVV-2B6SEH9 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ERVV-2B6SEH9 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ERVV-2B6SEH9 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
ERVV-2B6SEH9 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ERVV-2B6SEH9 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ERVV-2B6SEH9 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ERVV-2B6SEH9 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ERVV-2B6SEH9 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ERVV-2B6SEH9 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ERVV-2B6SEH9 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms