Protein–RNA interactions for Protein: A8MTQ0

NOTO, Homeobox protein notochord, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTOA8MTQ0 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NOTOA8MTQ0 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NOTOA8MTQ0 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NOTOA8MTQ0 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NOTOA8MTQ0 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NOTOA8MTQ0 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NOTOA8MTQ0 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NOTOA8MTQ0 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NOTOA8MTQ0 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NOTOA8MTQ0 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NOTOA8MTQ0 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
NOTOA8MTQ0 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
NOTOA8MTQ0 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NOTOA8MTQ0 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NOTOA8MTQ0 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NOTOA8MTQ0 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NOTOA8MTQ0 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NOTOA8MTQ0 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NOTOA8MTQ0 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NOTOA8MTQ0 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NOTOA8MTQ0 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NOTOA8MTQ0 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NOTOA8MTQ0 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NOTOA8MTQ0 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NOTOA8MTQ0 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NOTOA8MTQ0 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NOTOA8MTQ0 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NOTOA8MTQ0 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NOTOA8MTQ0 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NOTOA8MTQ0 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NOTOA8MTQ0 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
NOTOA8MTQ0 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NOTOA8MTQ0 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
NOTOA8MTQ0 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NOTOA8MTQ0 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NOTOA8MTQ0 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NOTOA8MTQ0 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NOTOA8MTQ0 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NOTOA8MTQ0 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NOTOA8MTQ0 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NOTOA8MTQ0 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NOTOA8MTQ0 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NOTOA8MTQ0 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NOTOA8MTQ0 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NOTOA8MTQ0 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NOTOA8MTQ0 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NOTOA8MTQ0 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
NOTOA8MTQ0 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
NOTOA8MTQ0 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NOTOA8MTQ0 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NOTOA8MTQ0 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NOTOA8MTQ0 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NOTOA8MTQ0 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NOTOA8MTQ0 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NOTOA8MTQ0 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NOTOA8MTQ0 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NOTOA8MTQ0 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NOTOA8MTQ0 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NOTOA8MTQ0 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NOTOA8MTQ0 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NOTOA8MTQ0 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NOTOA8MTQ0 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NOTOA8MTQ0 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NOTOA8MTQ0 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NOTOA8MTQ0 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NOTOA8MTQ0 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NOTOA8MTQ0 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NOTOA8MTQ0 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NOTOA8MTQ0 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NOTOA8MTQ0 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NOTOA8MTQ0 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NOTOA8MTQ0 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NOTOA8MTQ0 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NOTOA8MTQ0 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NOTOA8MTQ0 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NOTOA8MTQ0 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NOTOA8MTQ0 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NOTOA8MTQ0 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NOTOA8MTQ0 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NOTOA8MTQ0 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NOTOA8MTQ0 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
NOTOA8MTQ0 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NOTOA8MTQ0 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NOTOA8MTQ0 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NOTOA8MTQ0 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NOTOA8MTQ0 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NOTOA8MTQ0 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NOTOA8MTQ0 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NOTOA8MTQ0 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NOTOA8MTQ0 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NOTOA8MTQ0 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NOTOA8MTQ0 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NOTOA8MTQ0 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NOTOA8MTQ0 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NOTOA8MTQ0 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NOTOA8MTQ0 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NOTOA8MTQ0 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NOTOA8MTQ0 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NOTOA8MTQ0 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NOTOA8MTQ0 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms