Protein–RNA interactions for Protein: A6PVL3

KNCN, Kinocilin, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNCNA6PVL3 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KNCNA6PVL3 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KNCNA6PVL3 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KNCNA6PVL3 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KNCNA6PVL3 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KNCNA6PVL3 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
KNCNA6PVL3 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KNCNA6PVL3 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KNCNA6PVL3 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KNCNA6PVL3 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KNCNA6PVL3 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KNCNA6PVL3 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KNCNA6PVL3 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KNCNA6PVL3 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KNCNA6PVL3 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KNCNA6PVL3 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
KNCNA6PVL3 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
KNCNA6PVL3 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KNCNA6PVL3 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KNCNA6PVL3 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KNCNA6PVL3 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
KNCNA6PVL3 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
KNCNA6PVL3 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KNCNA6PVL3 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KNCNA6PVL3 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KNCNA6PVL3 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KNCNA6PVL3 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KNCNA6PVL3 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KNCNA6PVL3 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KNCNA6PVL3 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KNCNA6PVL3 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KNCNA6PVL3 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KNCNA6PVL3 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KNCNA6PVL3 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KNCNA6PVL3 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KNCNA6PVL3 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KNCNA6PVL3 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KNCNA6PVL3 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KNCNA6PVL3 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KNCNA6PVL3 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KNCNA6PVL3 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KNCNA6PVL3 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KNCNA6PVL3 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KNCNA6PVL3 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KNCNA6PVL3 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KNCNA6PVL3 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KNCNA6PVL3 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KNCNA6PVL3 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KNCNA6PVL3 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KNCNA6PVL3 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KNCNA6PVL3 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KNCNA6PVL3 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KNCNA6PVL3 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KNCNA6PVL3 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KNCNA6PVL3 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KNCNA6PVL3 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KNCNA6PVL3 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KNCNA6PVL3 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KNCNA6PVL3 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KNCNA6PVL3 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KNCNA6PVL3 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KNCNA6PVL3 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KNCNA6PVL3 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KNCNA6PVL3 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KNCNA6PVL3 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KNCNA6PVL3 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KNCNA6PVL3 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KNCNA6PVL3 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KNCNA6PVL3 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
KNCNA6PVL3 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KNCNA6PVL3 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KNCNA6PVL3 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KNCNA6PVL3 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KNCNA6PVL3 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KNCNA6PVL3 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KNCNA6PVL3 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KNCNA6PVL3 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KNCNA6PVL3 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KNCNA6PVL3 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KNCNA6PVL3 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
KNCNA6PVL3 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KNCNA6PVL3 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KNCNA6PVL3 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
KNCNA6PVL3 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KNCNA6PVL3 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KNCNA6PVL3 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
KNCNA6PVL3 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
KNCNA6PVL3 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KNCNA6PVL3 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KNCNA6PVL3 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
KNCNA6PVL3 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KNCNA6PVL3 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
KNCNA6PVL3 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KNCNA6PVL3 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KNCNA6PVL3 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KNCNA6PVL3 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KNCNA6PVL3 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
KNCNA6PVL3 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KNCNA6PVL3 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KNCNA6PVL3 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms