Protein–RNA interactions for Protein: A6NNP5

CCDC169, Coiled-coil domain-containing protein 169, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC169A6NNP5 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC169A6NNP5 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC169A6NNP5 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC169A6NNP5 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC169A6NNP5 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC169A6NNP5 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC169A6NNP5 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC169A6NNP5 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC169A6NNP5 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC169A6NNP5 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC169A6NNP5 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC169A6NNP5 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC169A6NNP5 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC169A6NNP5 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC169A6NNP5 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC169A6NNP5 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC169A6NNP5 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC169A6NNP5 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC169A6NNP5 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC169A6NNP5 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC169A6NNP5 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC169A6NNP5 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC169A6NNP5 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC169A6NNP5 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC169A6NNP5 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC169A6NNP5 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC169A6NNP5 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC169A6NNP5 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC169A6NNP5 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC169A6NNP5 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC169A6NNP5 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC169A6NNP5 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC169A6NNP5 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC169A6NNP5 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC169A6NNP5 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC169A6NNP5 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC169A6NNP5 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC169A6NNP5 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC169A6NNP5 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC169A6NNP5 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC169A6NNP5 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC169A6NNP5 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC169A6NNP5 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC169A6NNP5 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC169A6NNP5 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC169A6NNP5 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC169A6NNP5 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC169A6NNP5 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC169A6NNP5 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC169A6NNP5 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC169A6NNP5 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC169A6NNP5 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC169A6NNP5 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC169A6NNP5 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC169A6NNP5 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC169A6NNP5 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC169A6NNP5 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC169A6NNP5 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC169A6NNP5 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC169A6NNP5 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC169A6NNP5 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC169A6NNP5 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC169A6NNP5 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC169A6NNP5 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC169A6NNP5 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC169A6NNP5 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC169A6NNP5 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC169A6NNP5 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC169A6NNP5 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC169A6NNP5 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC169A6NNP5 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC169A6NNP5 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC169A6NNP5 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC169A6NNP5 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC169A6NNP5 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC169A6NNP5 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC169A6NNP5 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC169A6NNP5 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC169A6NNP5 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC169A6NNP5 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC169A6NNP5 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC169A6NNP5 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC169A6NNP5 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC169A6NNP5 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC169A6NNP5 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC169A6NNP5 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC169A6NNP5 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC169A6NNP5 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC169A6NNP5 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC169A6NNP5 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC169A6NNP5 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC169A6NNP5 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC169A6NNP5 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC169A6NNP5 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC169A6NNP5 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC169A6NNP5 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC169A6NNP5 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC169A6NNP5 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC169A6NNP5 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC169A6NNP5 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms