Protein–RNA interactions for Protein: A6NI87

CBY3, Protein chibby homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBY3A6NI87 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBY3A6NI87 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBY3A6NI87 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBY3A6NI87 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBY3A6NI87 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CBY3A6NI87 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBY3A6NI87 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBY3A6NI87 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBY3A6NI87 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBY3A6NI87 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBY3A6NI87 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBY3A6NI87 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBY3A6NI87 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBY3A6NI87 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBY3A6NI87 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBY3A6NI87 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBY3A6NI87 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBY3A6NI87 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBY3A6NI87 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBY3A6NI87 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBY3A6NI87 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBY3A6NI87 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBY3A6NI87 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBY3A6NI87 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CBY3A6NI87 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBY3A6NI87 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBY3A6NI87 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CBY3A6NI87 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBY3A6NI87 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CBY3A6NI87 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CBY3A6NI87 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CBY3A6NI87 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBY3A6NI87 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBY3A6NI87 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBY3A6NI87 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBY3A6NI87 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBY3A6NI87 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBY3A6NI87 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBY3A6NI87 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBY3A6NI87 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBY3A6NI87 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBY3A6NI87 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBY3A6NI87 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBY3A6NI87 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBY3A6NI87 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBY3A6NI87 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBY3A6NI87 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBY3A6NI87 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBY3A6NI87 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBY3A6NI87 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBY3A6NI87 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBY3A6NI87 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBY3A6NI87 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBY3A6NI87 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBY3A6NI87 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBY3A6NI87 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBY3A6NI87 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBY3A6NI87 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBY3A6NI87 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBY3A6NI87 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBY3A6NI87 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBY3A6NI87 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBY3A6NI87 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CBY3A6NI87 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBY3A6NI87 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBY3A6NI87 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBY3A6NI87 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBY3A6NI87 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBY3A6NI87 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBY3A6NI87 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBY3A6NI87 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBY3A6NI87 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBY3A6NI87 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBY3A6NI87 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBY3A6NI87 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBY3A6NI87 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBY3A6NI87 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CBY3A6NI87 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CBY3A6NI87 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CBY3A6NI87 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CBY3A6NI87 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CBY3A6NI87 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CBY3A6NI87 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CBY3A6NI87 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CBY3A6NI87 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CBY3A6NI87 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CBY3A6NI87 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CBY3A6NI87 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CBY3A6NI87 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CBY3A6NI87 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CBY3A6NI87 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CBY3A6NI87 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CBY3A6NI87 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CBY3A6NI87 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CBY3A6NI87 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CBY3A6NI87 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBY3A6NI87 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBY3A6NI87 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBY3A6NI87 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBY3A6NI87 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.8 ms