Protein–RNA interactions for Protein: A6NEF3

GOLGA6L4, Golgin subfamily A member 6-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L4A6NEF3 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GOLGA6L4A6NEF3 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GOLGA6L4A6NEF3 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GOLGA6L4A6NEF3 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GOLGA6L4A6NEF3 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
GOLGA6L4A6NEF3 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GOLGA6L4A6NEF3 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GOLGA6L4A6NEF3 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GOLGA6L4A6NEF3 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GOLGA6L4A6NEF3 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GOLGA6L4A6NEF3 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GOLGA6L4A6NEF3 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GOLGA6L4A6NEF3 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GOLGA6L4A6NEF3 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GOLGA6L4A6NEF3 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GOLGA6L4A6NEF3 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GOLGA6L4A6NEF3 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GOLGA6L4A6NEF3 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GOLGA6L4A6NEF3 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
GOLGA6L4A6NEF3 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
GOLGA6L4A6NEF3 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GOLGA6L4A6NEF3 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GOLGA6L4A6NEF3 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GOLGA6L4A6NEF3 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GOLGA6L4A6NEF3 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GOLGA6L4A6NEF3 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GOLGA6L4A6NEF3 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GOLGA6L4A6NEF3 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GOLGA6L4A6NEF3 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GOLGA6L4A6NEF3 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GOLGA6L4A6NEF3 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GOLGA6L4A6NEF3 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
GOLGA6L4A6NEF3 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GOLGA6L4A6NEF3 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GOLGA6L4A6NEF3 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GOLGA6L4A6NEF3 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GOLGA6L4A6NEF3 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GOLGA6L4A6NEF3 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GOLGA6L4A6NEF3 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GOLGA6L4A6NEF3 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GOLGA6L4A6NEF3 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GOLGA6L4A6NEF3 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GOLGA6L4A6NEF3 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GOLGA6L4A6NEF3 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
GOLGA6L4A6NEF3 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GOLGA6L4A6NEF3 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GOLGA6L4A6NEF3 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GOLGA6L4A6NEF3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
GOLGA6L4A6NEF3 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GOLGA6L4A6NEF3 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GOLGA6L4A6NEF3 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
GOLGA6L4A6NEF3 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GOLGA6L4A6NEF3 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GOLGA6L4A6NEF3 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GOLGA6L4A6NEF3 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GOLGA6L4A6NEF3 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
GOLGA6L4A6NEF3 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GOLGA6L4A6NEF3 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GOLGA6L4A6NEF3 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GOLGA6L4A6NEF3 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GOLGA6L4A6NEF3 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GOLGA6L4A6NEF3 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GOLGA6L4A6NEF3 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GOLGA6L4A6NEF3 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GOLGA6L4A6NEF3 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GOLGA6L4A6NEF3 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GOLGA6L4A6NEF3 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GOLGA6L4A6NEF3 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GOLGA6L4A6NEF3 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
GOLGA6L4A6NEF3 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GOLGA6L4A6NEF3 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GOLGA6L4A6NEF3 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GOLGA6L4A6NEF3 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GOLGA6L4A6NEF3 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GOLGA6L4A6NEF3 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GOLGA6L4A6NEF3 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GOLGA6L4A6NEF3 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GOLGA6L4A6NEF3 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GOLGA6L4A6NEF3 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GOLGA6L4A6NEF3 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GOLGA6L4A6NEF3 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GOLGA6L4A6NEF3 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GOLGA6L4A6NEF3 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GOLGA6L4A6NEF3 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GOLGA6L4A6NEF3 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
GOLGA6L4A6NEF3 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GOLGA6L4A6NEF3 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
GOLGA6L4A6NEF3 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
GOLGA6L4A6NEF3 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
GOLGA6L4A6NEF3 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GOLGA6L4A6NEF3 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GOLGA6L4A6NEF3 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GOLGA6L4A6NEF3 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GOLGA6L4A6NEF3 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GOLGA6L4A6NEF3 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GOLGA6L4A6NEF3 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GOLGA6L4A6NEF3 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GOLGA6L4A6NEF3 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GOLGA6L4A6NEF3 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms