Protein–RNA interactions for Protein: A6NDN3

GOLGA6B, Golgin subfamily A member 6B, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6BA6NDN3 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GOLGA6BA6NDN3 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GOLGA6BA6NDN3 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GOLGA6BA6NDN3 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GOLGA6BA6NDN3 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GOLGA6BA6NDN3 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GOLGA6BA6NDN3 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
GOLGA6BA6NDN3 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
GOLGA6BA6NDN3 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GOLGA6BA6NDN3 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GOLGA6BA6NDN3 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GOLGA6BA6NDN3 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GOLGA6BA6NDN3 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GOLGA6BA6NDN3 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GOLGA6BA6NDN3 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GOLGA6BA6NDN3 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GOLGA6BA6NDN3 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GOLGA6BA6NDN3 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GOLGA6BA6NDN3 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GOLGA6BA6NDN3 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GOLGA6BA6NDN3 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GOLGA6BA6NDN3 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GOLGA6BA6NDN3 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GOLGA6BA6NDN3 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
GOLGA6BA6NDN3 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GOLGA6BA6NDN3 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GOLGA6BA6NDN3 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GOLGA6BA6NDN3 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GOLGA6BA6NDN3 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GOLGA6BA6NDN3 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GOLGA6BA6NDN3 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GOLGA6BA6NDN3 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GOLGA6BA6NDN3 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GOLGA6BA6NDN3 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GOLGA6BA6NDN3 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GOLGA6BA6NDN3 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GOLGA6BA6NDN3 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GOLGA6BA6NDN3 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GOLGA6BA6NDN3 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GOLGA6BA6NDN3 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GOLGA6BA6NDN3 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GOLGA6BA6NDN3 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GOLGA6BA6NDN3 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GOLGA6BA6NDN3 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GOLGA6BA6NDN3 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GOLGA6BA6NDN3 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GOLGA6BA6NDN3 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GOLGA6BA6NDN3 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GOLGA6BA6NDN3 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GOLGA6BA6NDN3 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
GOLGA6BA6NDN3 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GOLGA6BA6NDN3 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GOLGA6BA6NDN3 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GOLGA6BA6NDN3 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GOLGA6BA6NDN3 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GOLGA6BA6NDN3 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GOLGA6BA6NDN3 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GOLGA6BA6NDN3 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GOLGA6BA6NDN3 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GOLGA6BA6NDN3 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GOLGA6BA6NDN3 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GOLGA6BA6NDN3 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GOLGA6BA6NDN3 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GOLGA6BA6NDN3 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GOLGA6BA6NDN3 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GOLGA6BA6NDN3 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GOLGA6BA6NDN3 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GOLGA6BA6NDN3 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GOLGA6BA6NDN3 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GOLGA6BA6NDN3 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GOLGA6BA6NDN3 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GOLGA6BA6NDN3 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GOLGA6BA6NDN3 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GOLGA6BA6NDN3 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GOLGA6BA6NDN3 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GOLGA6BA6NDN3 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
GOLGA6BA6NDN3 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
GOLGA6BA6NDN3 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GOLGA6BA6NDN3 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GOLGA6BA6NDN3 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GOLGA6BA6NDN3 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GOLGA6BA6NDN3 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GOLGA6BA6NDN3 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GOLGA6BA6NDN3 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GOLGA6BA6NDN3 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GOLGA6BA6NDN3 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GOLGA6BA6NDN3 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GOLGA6BA6NDN3 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GOLGA6BA6NDN3 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GOLGA6BA6NDN3 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GOLGA6BA6NDN3 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GOLGA6BA6NDN3 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GOLGA6BA6NDN3 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
GOLGA6BA6NDN3 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GOLGA6BA6NDN3 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
GOLGA6BA6NDN3 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GOLGA6BA6NDN3 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GOLGA6BA6NDN3 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GOLGA6BA6NDN3 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GOLGA6BA6NDN3 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms