Protein–RNA interactions for Protein: A6NDD5

SYNDIG1L, Synapse differentiation-inducing gene protein 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNDIG1LA6NDD5 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYNDIG1LA6NDD5 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYNDIG1LA6NDD5 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYNDIG1LA6NDD5 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYNDIG1LA6NDD5 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SYNDIG1LA6NDD5 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SYNDIG1LA6NDD5 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYNDIG1LA6NDD5 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYNDIG1LA6NDD5 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYNDIG1LA6NDD5 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYNDIG1LA6NDD5 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SYNDIG1LA6NDD5 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYNDIG1LA6NDD5 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYNDIG1LA6NDD5 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYNDIG1LA6NDD5 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYNDIG1LA6NDD5 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYNDIG1LA6NDD5 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYNDIG1LA6NDD5 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYNDIG1LA6NDD5 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SYNDIG1LA6NDD5 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYNDIG1LA6NDD5 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYNDIG1LA6NDD5 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYNDIG1LA6NDD5 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYNDIG1LA6NDD5 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYNDIG1LA6NDD5 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYNDIG1LA6NDD5 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYNDIG1LA6NDD5 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYNDIG1LA6NDD5 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYNDIG1LA6NDD5 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYNDIG1LA6NDD5 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYNDIG1LA6NDD5 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYNDIG1LA6NDD5 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYNDIG1LA6NDD5 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYNDIG1LA6NDD5 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYNDIG1LA6NDD5 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYNDIG1LA6NDD5 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYNDIG1LA6NDD5 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYNDIG1LA6NDD5 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYNDIG1LA6NDD5 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYNDIG1LA6NDD5 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYNDIG1LA6NDD5 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYNDIG1LA6NDD5 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYNDIG1LA6NDD5 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYNDIG1LA6NDD5 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYNDIG1LA6NDD5 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYNDIG1LA6NDD5 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYNDIG1LA6NDD5 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYNDIG1LA6NDD5 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYNDIG1LA6NDD5 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SYNDIG1LA6NDD5 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SYNDIG1LA6NDD5 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SYNDIG1LA6NDD5 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SYNDIG1LA6NDD5 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SYNDIG1LA6NDD5 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SYNDIG1LA6NDD5 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SYNDIG1LA6NDD5 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SYNDIG1LA6NDD5 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SYNDIG1LA6NDD5 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
SYNDIG1LA6NDD5 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SYNDIG1LA6NDD5 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
SYNDIG1LA6NDD5 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
SYNDIG1LA6NDD5 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
SYNDIG1LA6NDD5 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
SYNDIG1LA6NDD5 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SYNDIG1LA6NDD5 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SYNDIG1LA6NDD5 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
SYNDIG1LA6NDD5 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SYNDIG1LA6NDD5 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
SYNDIG1LA6NDD5 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SYNDIG1LA6NDD5 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SYNDIG1LA6NDD5 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SYNDIG1LA6NDD5 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SYNDIG1LA6NDD5 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SYNDIG1LA6NDD5 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SYNDIG1LA6NDD5 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SYNDIG1LA6NDD5 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SYNDIG1LA6NDD5 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SYNDIG1LA6NDD5 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SYNDIG1LA6NDD5 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SYNDIG1LA6NDD5 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SYNDIG1LA6NDD5 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SYNDIG1LA6NDD5 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SYNDIG1LA6NDD5 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SYNDIG1LA6NDD5 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SYNDIG1LA6NDD5 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SYNDIG1LA6NDD5 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SYNDIG1LA6NDD5 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SYNDIG1LA6NDD5 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SYNDIG1LA6NDD5 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SYNDIG1LA6NDD5 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SYNDIG1LA6NDD5 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SYNDIG1LA6NDD5 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
SYNDIG1LA6NDD5 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SYNDIG1LA6NDD5 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SYNDIG1LA6NDD5 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SYNDIG1LA6NDD5 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SYNDIG1LA6NDD5 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
SYNDIG1LA6NDD5 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SYNDIG1LA6NDD5 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SYNDIG1LA6NDD5 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms