Protein–RNA interactions for Protein: A6NCW7

USP17L4, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L4A6NCW7 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP17L4A6NCW7 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP17L4A6NCW7 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP17L4A6NCW7 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP17L4A6NCW7 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP17L4A6NCW7 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP17L4A6NCW7 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP17L4A6NCW7 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP17L4A6NCW7 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP17L4A6NCW7 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP17L4A6NCW7 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
USP17L4A6NCW7 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP17L4A6NCW7 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP17L4A6NCW7 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP17L4A6NCW7 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP17L4A6NCW7 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP17L4A6NCW7 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP17L4A6NCW7 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP17L4A6NCW7 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP17L4A6NCW7 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP17L4A6NCW7 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP17L4A6NCW7 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
USP17L4A6NCW7 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP17L4A6NCW7 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP17L4A6NCW7 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP17L4A6NCW7 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP17L4A6NCW7 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP17L4A6NCW7 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
USP17L4A6NCW7 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP17L4A6NCW7 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
USP17L4A6NCW7 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
USP17L4A6NCW7 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP17L4A6NCW7 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP17L4A6NCW7 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP17L4A6NCW7 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP17L4A6NCW7 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP17L4A6NCW7 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP17L4A6NCW7 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP17L4A6NCW7 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP17L4A6NCW7 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP17L4A6NCW7 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP17L4A6NCW7 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
USP17L4A6NCW7 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP17L4A6NCW7 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP17L4A6NCW7 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP17L4A6NCW7 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP17L4A6NCW7 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP17L4A6NCW7 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
USP17L4A6NCW7 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP17L4A6NCW7 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP17L4A6NCW7 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP17L4A6NCW7 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP17L4A6NCW7 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP17L4A6NCW7 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP17L4A6NCW7 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP17L4A6NCW7 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP17L4A6NCW7 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP17L4A6NCW7 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP17L4A6NCW7 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP17L4A6NCW7 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
USP17L4A6NCW7 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP17L4A6NCW7 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
USP17L4A6NCW7 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
USP17L4A6NCW7 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP17L4A6NCW7 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP17L4A6NCW7 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP17L4A6NCW7 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP17L4A6NCW7 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP17L4A6NCW7 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
USP17L4A6NCW7 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP17L4A6NCW7 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP17L4A6NCW7 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP17L4A6NCW7 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP17L4A6NCW7 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP17L4A6NCW7 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP17L4A6NCW7 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP17L4A6NCW7 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP17L4A6NCW7 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
USP17L4A6NCW7 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP17L4A6NCW7 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP17L4A6NCW7 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP17L4A6NCW7 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP17L4A6NCW7 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP17L4A6NCW7 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP17L4A6NCW7 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP17L4A6NCW7 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP17L4A6NCW7 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP17L4A6NCW7 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP17L4A6NCW7 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP17L4A6NCW7 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP17L4A6NCW7 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP17L4A6NCW7 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
USP17L4A6NCW7 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP17L4A6NCW7 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP17L4A6NCW7 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP17L4A6NCW7 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
USP17L4A6NCW7 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP17L4A6NCW7 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP17L4A6NCW7 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP17L4A6NCW7 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms