Protein–RNA interactions for Protein: U3KQ87

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQ87 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
U3KQ87 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
U3KQ87 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
U3KQ87 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
U3KQ87 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
U3KQ87 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
U3KQ87 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
U3KQ87 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
U3KQ87 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
U3KQ87 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
U3KQ87 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
U3KQ87 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
U3KQ87 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
U3KQ87 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
U3KQ87 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
U3KQ87 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
U3KQ87 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
U3KQ87 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
U3KQ87 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
U3KQ87 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
U3KQ87 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
U3KQ87 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
U3KQ87 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
U3KQ87 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
U3KQ87 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
U3KQ87 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
U3KQ87 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
U3KQ87 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
U3KQ87 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
U3KQ87 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
U3KQ87 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
U3KQ87 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
U3KQ87 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
U3KQ87 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
U3KQ87 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
U3KQ87 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
U3KQ87 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
U3KQ87 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
U3KQ87 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
U3KQ87 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
U3KQ87 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
U3KQ87 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
U3KQ87 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
U3KQ87 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
U3KQ87 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
U3KQ87 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
U3KQ87 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
U3KQ87 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
U3KQ87 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
U3KQ87 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
U3KQ87 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
U3KQ87 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
U3KQ87 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
U3KQ87 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
U3KQ87 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
U3KQ87 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
U3KQ87 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
U3KQ87 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
U3KQ87 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
U3KQ87 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
U3KQ87 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
U3KQ87 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
U3KQ87 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
U3KQ87 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
U3KQ87 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
U3KQ87 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
U3KQ87 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
U3KQ87 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
U3KQ87 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
U3KQ87 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
U3KQ87 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
U3KQ87 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
U3KQ87 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
U3KQ87 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
U3KQ87 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
U3KQ87 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
U3KQ87 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
U3KQ87 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
U3KQ87 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
U3KQ87 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
U3KQ87 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
U3KQ87 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
U3KQ87 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
U3KQ87 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
U3KQ87 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
U3KQ87 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
U3KQ87 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
U3KQ87 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
U3KQ87 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
U3KQ87 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
U3KQ87 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
U3KQ87 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
U3KQ87 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
U3KQ87 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
U3KQ87 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
U3KQ87 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
U3KQ87 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
U3KQ87 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
U3KQ87 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
U3KQ87 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms