Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Y1

CAMTA1, Calmodulin-binding transcription activator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMTA1Q9Y6Y1 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CAMTA1Q9Y6Y1 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CAMTA1Q9Y6Y1 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CAMTA1Q9Y6Y1 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CAMTA1Q9Y6Y1 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CAMTA1Q9Y6Y1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CAMTA1Q9Y6Y1 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CAMTA1Q9Y6Y1 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CAMTA1Q9Y6Y1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CAMTA1Q9Y6Y1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CAMTA1Q9Y6Y1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CAMTA1Q9Y6Y1 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CAMTA1Q9Y6Y1 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CAMTA1Q9Y6Y1 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CAMTA1Q9Y6Y1 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CAMTA1Q9Y6Y1 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CAMTA1Q9Y6Y1 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CAMTA1Q9Y6Y1 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CAMTA1Q9Y6Y1 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
CAMTA1Q9Y6Y1 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
CAMTA1Q9Y6Y1 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CAMTA1Q9Y6Y1 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CAMTA1Q9Y6Y1 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CAMTA1Q9Y6Y1 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CAMTA1Q9Y6Y1 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CAMTA1Q9Y6Y1 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CAMTA1Q9Y6Y1 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CAMTA1Q9Y6Y1 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
CAMTA1Q9Y6Y1 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CAMTA1Q9Y6Y1 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CAMTA1Q9Y6Y1 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CAMTA1Q9Y6Y1 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CAMTA1Q9Y6Y1 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CAMTA1Q9Y6Y1 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
CAMTA1Q9Y6Y1 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CAMTA1Q9Y6Y1 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CAMTA1Q9Y6Y1 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CAMTA1Q9Y6Y1 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CAMTA1Q9Y6Y1 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CAMTA1Q9Y6Y1 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CAMTA1Q9Y6Y1 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CAMTA1Q9Y6Y1 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CAMTA1Q9Y6Y1 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CAMTA1Q9Y6Y1 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CAMTA1Q9Y6Y1 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CAMTA1Q9Y6Y1 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CAMTA1Q9Y6Y1 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CAMTA1Q9Y6Y1 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CAMTA1Q9Y6Y1 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CAMTA1Q9Y6Y1 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CAMTA1Q9Y6Y1 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CAMTA1Q9Y6Y1 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CAMTA1Q9Y6Y1 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CAMTA1Q9Y6Y1 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CAMTA1Q9Y6Y1 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CAMTA1Q9Y6Y1 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CAMTA1Q9Y6Y1 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CAMTA1Q9Y6Y1 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CAMTA1Q9Y6Y1 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
CAMTA1Q9Y6Y1 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CAMTA1Q9Y6Y1 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CAMTA1Q9Y6Y1 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CAMTA1Q9Y6Y1 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CAMTA1Q9Y6Y1 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CAMTA1Q9Y6Y1 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CAMTA1Q9Y6Y1 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CAMTA1Q9Y6Y1 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
CAMTA1Q9Y6Y1 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CAMTA1Q9Y6Y1 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CAMTA1Q9Y6Y1 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CAMTA1Q9Y6Y1 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CAMTA1Q9Y6Y1 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CAMTA1Q9Y6Y1 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC27.53■■■□□ 2
CAMTA1Q9Y6Y1 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CAMTA1Q9Y6Y1 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CAMTA1Q9Y6Y1 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CAMTA1Q9Y6Y1 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CAMTA1Q9Y6Y1 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
CAMTA1Q9Y6Y1 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CAMTA1Q9Y6Y1 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
CAMTA1Q9Y6Y1 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
CAMTA1Q9Y6Y1 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CAMTA1Q9Y6Y1 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CAMTA1Q9Y6Y1 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CAMTA1Q9Y6Y1 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CAMTA1Q9Y6Y1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CAMTA1Q9Y6Y1 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CAMTA1Q9Y6Y1 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CAMTA1Q9Y6Y1 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CAMTA1Q9Y6Y1 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CAMTA1Q9Y6Y1 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CAMTA1Q9Y6Y1 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CAMTA1Q9Y6Y1 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CAMTA1Q9Y6Y1 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CAMTA1Q9Y6Y1 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CAMTA1Q9Y6Y1 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CAMTA1Q9Y6Y1 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CAMTA1Q9Y6Y1 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CAMTA1Q9Y6Y1 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CAMTA1Q9Y6Y1 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms