Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6F1

PARP3, Poly [ADP-ribose] polymerase 3, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP3Q9Y6F1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PARP3Q9Y6F1 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PARP3Q9Y6F1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PARP3Q9Y6F1 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PARP3Q9Y6F1 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PARP3Q9Y6F1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PARP3Q9Y6F1 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PARP3Q9Y6F1 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PARP3Q9Y6F1 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PARP3Q9Y6F1 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
PARP3Q9Y6F1 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PARP3Q9Y6F1 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PARP3Q9Y6F1 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PARP3Q9Y6F1 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PARP3Q9Y6F1 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PARP3Q9Y6F1 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PARP3Q9Y6F1 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PARP3Q9Y6F1 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PARP3Q9Y6F1 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PARP3Q9Y6F1 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PARP3Q9Y6F1 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PARP3Q9Y6F1 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
PARP3Q9Y6F1 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PARP3Q9Y6F1 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PARP3Q9Y6F1 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PARP3Q9Y6F1 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PARP3Q9Y6F1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PARP3Q9Y6F1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PARP3Q9Y6F1 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PARP3Q9Y6F1 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PARP3Q9Y6F1 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PARP3Q9Y6F1 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PARP3Q9Y6F1 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PARP3Q9Y6F1 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PARP3Q9Y6F1 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
PARP3Q9Y6F1 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PARP3Q9Y6F1 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PARP3Q9Y6F1 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PARP3Q9Y6F1 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PARP3Q9Y6F1 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PARP3Q9Y6F1 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PARP3Q9Y6F1 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PARP3Q9Y6F1 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PARP3Q9Y6F1 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PARP3Q9Y6F1 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PARP3Q9Y6F1 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PARP3Q9Y6F1 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PARP3Q9Y6F1 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PARP3Q9Y6F1 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PARP3Q9Y6F1 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PARP3Q9Y6F1 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PARP3Q9Y6F1 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PARP3Q9Y6F1 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PARP3Q9Y6F1 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PARP3Q9Y6F1 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PARP3Q9Y6F1 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PARP3Q9Y6F1 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PARP3Q9Y6F1 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PARP3Q9Y6F1 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PARP3Q9Y6F1 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PARP3Q9Y6F1 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PARP3Q9Y6F1 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PARP3Q9Y6F1 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PARP3Q9Y6F1 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PARP3Q9Y6F1 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PARP3Q9Y6F1 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PARP3Q9Y6F1 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PARP3Q9Y6F1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PARP3Q9Y6F1 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PARP3Q9Y6F1 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PARP3Q9Y6F1 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PARP3Q9Y6F1 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PARP3Q9Y6F1 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PARP3Q9Y6F1 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PARP3Q9Y6F1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PARP3Q9Y6F1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PARP3Q9Y6F1 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PARP3Q9Y6F1 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PARP3Q9Y6F1 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PARP3Q9Y6F1 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PARP3Q9Y6F1 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PARP3Q9Y6F1 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PARP3Q9Y6F1 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PARP3Q9Y6F1 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PARP3Q9Y6F1 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PARP3Q9Y6F1 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PARP3Q9Y6F1 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PARP3Q9Y6F1 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PARP3Q9Y6F1 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PARP3Q9Y6F1 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PARP3Q9Y6F1 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PARP3Q9Y6F1 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PARP3Q9Y6F1 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PARP3Q9Y6F1 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PARP3Q9Y6F1 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PARP3Q9Y6F1 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PARP3Q9Y6F1 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PARP3Q9Y6F1 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PARP3Q9Y6F1 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PARP3Q9Y6F1 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms