Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Y9

SCN10A, Sodium channel protein type 10 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN10AQ9Y5Y9 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCN10AQ9Y5Y9 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCN10AQ9Y5Y9 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCN10AQ9Y5Y9 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCN10AQ9Y5Y9 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCN10AQ9Y5Y9 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCN10AQ9Y5Y9 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SCN10AQ9Y5Y9 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SCN10AQ9Y5Y9 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCN10AQ9Y5Y9 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCN10AQ9Y5Y9 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCN10AQ9Y5Y9 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCN10AQ9Y5Y9 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCN10AQ9Y5Y9 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCN10AQ9Y5Y9 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCN10AQ9Y5Y9 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCN10AQ9Y5Y9 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCN10AQ9Y5Y9 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCN10AQ9Y5Y9 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SCN10AQ9Y5Y9 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCN10AQ9Y5Y9 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCN10AQ9Y5Y9 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCN10AQ9Y5Y9 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCN10AQ9Y5Y9 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCN10AQ9Y5Y9 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCN10AQ9Y5Y9 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCN10AQ9Y5Y9 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCN10AQ9Y5Y9 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCN10AQ9Y5Y9 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCN10AQ9Y5Y9 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCN10AQ9Y5Y9 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCN10AQ9Y5Y9 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCN10AQ9Y5Y9 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCN10AQ9Y5Y9 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCN10AQ9Y5Y9 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCN10AQ9Y5Y9 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCN10AQ9Y5Y9 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCN10AQ9Y5Y9 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCN10AQ9Y5Y9 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SCN10AQ9Y5Y9 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SCN10AQ9Y5Y9 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCN10AQ9Y5Y9 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SCN10AQ9Y5Y9 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCN10AQ9Y5Y9 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCN10AQ9Y5Y9 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCN10AQ9Y5Y9 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCN10AQ9Y5Y9 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCN10AQ9Y5Y9 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCN10AQ9Y5Y9 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCN10AQ9Y5Y9 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCN10AQ9Y5Y9 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCN10AQ9Y5Y9 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCN10AQ9Y5Y9 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCN10AQ9Y5Y9 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCN10AQ9Y5Y9 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCN10AQ9Y5Y9 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCN10AQ9Y5Y9 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCN10AQ9Y5Y9 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SCN10AQ9Y5Y9 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCN10AQ9Y5Y9 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCN10AQ9Y5Y9 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCN10AQ9Y5Y9 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCN10AQ9Y5Y9 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCN10AQ9Y5Y9 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SCN10AQ9Y5Y9 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SCN10AQ9Y5Y9 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SCN10AQ9Y5Y9 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SCN10AQ9Y5Y9 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SCN10AQ9Y5Y9 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
SCN10AQ9Y5Y9 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCN10AQ9Y5Y9 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCN10AQ9Y5Y9 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCN10AQ9Y5Y9 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCN10AQ9Y5Y9 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCN10AQ9Y5Y9 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCN10AQ9Y5Y9 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCN10AQ9Y5Y9 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCN10AQ9Y5Y9 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCN10AQ9Y5Y9 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCN10AQ9Y5Y9 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCN10AQ9Y5Y9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCN10AQ9Y5Y9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCN10AQ9Y5Y9 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCN10AQ9Y5Y9 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCN10AQ9Y5Y9 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCN10AQ9Y5Y9 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCN10AQ9Y5Y9 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCN10AQ9Y5Y9 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCN10AQ9Y5Y9 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCN10AQ9Y5Y9 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCN10AQ9Y5Y9 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCN10AQ9Y5Y9 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCN10AQ9Y5Y9 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCN10AQ9Y5Y9 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCN10AQ9Y5Y9 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCN10AQ9Y5Y9 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCN10AQ9Y5Y9 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCN10AQ9Y5Y9 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCN10AQ9Y5Y9 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCN10AQ9Y5Y9 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms