Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5F1

PCDHB12, Protocadherin beta-12, humanhuman

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB12Q9Y5F1 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PCDHB12Q9Y5F1 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCDHB12Q9Y5F1 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCDHB12Q9Y5F1 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCDHB12Q9Y5F1 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCDHB12Q9Y5F1 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCDHB12Q9Y5F1 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCDHB12Q9Y5F1 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCDHB12Q9Y5F1 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCDHB12Q9Y5F1 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCDHB12Q9Y5F1 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCDHB12Q9Y5F1 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCDHB12Q9Y5F1 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCDHB12Q9Y5F1 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCDHB12Q9Y5F1 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCDHB12Q9Y5F1 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCDHB12Q9Y5F1 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCDHB12Q9Y5F1 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PCDHB12Q9Y5F1 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PCDHB12Q9Y5F1 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCDHB12Q9Y5F1 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCDHB12Q9Y5F1 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCDHB12Q9Y5F1 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCDHB12Q9Y5F1 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCDHB12Q9Y5F1 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCDHB12Q9Y5F1 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCDHB12Q9Y5F1 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PCDHB12Q9Y5F1 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PCDHB12Q9Y5F1 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PCDHB12Q9Y5F1 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PCDHB12Q9Y5F1 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PCDHB12Q9Y5F1 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PCDHB12Q9Y5F1 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PCDHB12Q9Y5F1 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCDHB12Q9Y5F1 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCDHB12Q9Y5F1 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCDHB12Q9Y5F1 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCDHB12Q9Y5F1 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCDHB12Q9Y5F1 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCDHB12Q9Y5F1 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCDHB12Q9Y5F1 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCDHB12Q9Y5F1 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCDHB12Q9Y5F1 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCDHB12Q9Y5F1 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCDHB12Q9Y5F1 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCDHB12Q9Y5F1 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCDHB12Q9Y5F1 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCDHB12Q9Y5F1 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCDHB12Q9Y5F1 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCDHB12Q9Y5F1 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCDHB12Q9Y5F1 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCDHB12Q9Y5F1 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCDHB12Q9Y5F1 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCDHB12Q9Y5F1 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCDHB12Q9Y5F1 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCDHB12Q9Y5F1 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCDHB12Q9Y5F1 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCDHB12Q9Y5F1 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCDHB12Q9Y5F1 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCDHB12Q9Y5F1 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PCDHB12Q9Y5F1 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCDHB12Q9Y5F1 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCDHB12Q9Y5F1 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCDHB12Q9Y5F1 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCDHB12Q9Y5F1 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCDHB12Q9Y5F1 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PCDHB12Q9Y5F1 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCDHB12Q9Y5F1 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCDHB12Q9Y5F1 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCDHB12Q9Y5F1 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCDHB12Q9Y5F1 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCDHB12Q9Y5F1 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCDHB12Q9Y5F1 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PCDHB12Q9Y5F1 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCDHB12Q9Y5F1 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCDHB12Q9Y5F1 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCDHB12Q9Y5F1 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCDHB12Q9Y5F1 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCDHB12Q9Y5F1 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCDHB12Q9Y5F1 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCDHB12Q9Y5F1 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCDHB12Q9Y5F1 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCDHB12Q9Y5F1 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCDHB12Q9Y5F1 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCDHB12Q9Y5F1 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCDHB12Q9Y5F1 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCDHB12Q9Y5F1 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCDHB12Q9Y5F1 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PCDHB12Q9Y5F1 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCDHB12Q9Y5F1 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCDHB12Q9Y5F1 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCDHB12Q9Y5F1 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PCDHB12Q9Y5F1 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCDHB12Q9Y5F1 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCDHB12Q9Y5F1 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCDHB12Q9Y5F1 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCDHB12Q9Y5F1 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCDHB12Q9Y5F1 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCDHB12Q9Y5F1 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCDHB12Q9Y5F1 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms