Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3T6

R3HCC1, R3H and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HCC1Q9Y3T6 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
R3HCC1Q9Y3T6 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
R3HCC1Q9Y3T6 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
R3HCC1Q9Y3T6 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
R3HCC1Q9Y3T6 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
R3HCC1Q9Y3T6 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
R3HCC1Q9Y3T6 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
R3HCC1Q9Y3T6 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
R3HCC1Q9Y3T6 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
R3HCC1Q9Y3T6 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
R3HCC1Q9Y3T6 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
R3HCC1Q9Y3T6 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
R3HCC1Q9Y3T6 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
R3HCC1Q9Y3T6 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
R3HCC1Q9Y3T6 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
R3HCC1Q9Y3T6 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
R3HCC1Q9Y3T6 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
R3HCC1Q9Y3T6 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
R3HCC1Q9Y3T6 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
R3HCC1Q9Y3T6 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
R3HCC1Q9Y3T6 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
R3HCC1Q9Y3T6 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
R3HCC1Q9Y3T6 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
R3HCC1Q9Y3T6 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
R3HCC1Q9Y3T6 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
R3HCC1Q9Y3T6 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
R3HCC1Q9Y3T6 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
R3HCC1Q9Y3T6 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
R3HCC1Q9Y3T6 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
R3HCC1Q9Y3T6 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
R3HCC1Q9Y3T6 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
R3HCC1Q9Y3T6 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
R3HCC1Q9Y3T6 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
R3HCC1Q9Y3T6 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
R3HCC1Q9Y3T6 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
R3HCC1Q9Y3T6 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
R3HCC1Q9Y3T6 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
R3HCC1Q9Y3T6 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
R3HCC1Q9Y3T6 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
R3HCC1Q9Y3T6 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
R3HCC1Q9Y3T6 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
R3HCC1Q9Y3T6 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
R3HCC1Q9Y3T6 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
R3HCC1Q9Y3T6 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
R3HCC1Q9Y3T6 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
R3HCC1Q9Y3T6 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
R3HCC1Q9Y3T6 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
R3HCC1Q9Y3T6 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
R3HCC1Q9Y3T6 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
R3HCC1Q9Y3T6 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
R3HCC1Q9Y3T6 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
R3HCC1Q9Y3T6 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
R3HCC1Q9Y3T6 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
R3HCC1Q9Y3T6 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
R3HCC1Q9Y3T6 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
R3HCC1Q9Y3T6 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
R3HCC1Q9Y3T6 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
R3HCC1Q9Y3T6 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
R3HCC1Q9Y3T6 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
R3HCC1Q9Y3T6 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
R3HCC1Q9Y3T6 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
R3HCC1Q9Y3T6 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
R3HCC1Q9Y3T6 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
R3HCC1Q9Y3T6 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
R3HCC1Q9Y3T6 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
R3HCC1Q9Y3T6 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
R3HCC1Q9Y3T6 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
R3HCC1Q9Y3T6 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
R3HCC1Q9Y3T6 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
R3HCC1Q9Y3T6 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
R3HCC1Q9Y3T6 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
R3HCC1Q9Y3T6 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
R3HCC1Q9Y3T6 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
R3HCC1Q9Y3T6 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
R3HCC1Q9Y3T6 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
R3HCC1Q9Y3T6 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
R3HCC1Q9Y3T6 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
R3HCC1Q9Y3T6 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
R3HCC1Q9Y3T6 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
R3HCC1Q9Y3T6 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
R3HCC1Q9Y3T6 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
R3HCC1Q9Y3T6 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
R3HCC1Q9Y3T6 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
R3HCC1Q9Y3T6 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
R3HCC1Q9Y3T6 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
R3HCC1Q9Y3T6 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
R3HCC1Q9Y3T6 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
R3HCC1Q9Y3T6 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
R3HCC1Q9Y3T6 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
R3HCC1Q9Y3T6 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
R3HCC1Q9Y3T6 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
R3HCC1Q9Y3T6 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
R3HCC1Q9Y3T6 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
R3HCC1Q9Y3T6 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
R3HCC1Q9Y3T6 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
R3HCC1Q9Y3T6 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
R3HCC1Q9Y3T6 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
R3HCC1Q9Y3T6 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
R3HCC1Q9Y3T6 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
R3HCC1Q9Y3T6 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms