Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Y8

PRG3, Proteoglycan 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG3Q9Y2Y8 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRG3Q9Y2Y8 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRG3Q9Y2Y8 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PRG3Q9Y2Y8 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PRG3Q9Y2Y8 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRG3Q9Y2Y8 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRG3Q9Y2Y8 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRG3Q9Y2Y8 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRG3Q9Y2Y8 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRG3Q9Y2Y8 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRG3Q9Y2Y8 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRG3Q9Y2Y8 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRG3Q9Y2Y8 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRG3Q9Y2Y8 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRG3Q9Y2Y8 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRG3Q9Y2Y8 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRG3Q9Y2Y8 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRG3Q9Y2Y8 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRG3Q9Y2Y8 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRG3Q9Y2Y8 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRG3Q9Y2Y8 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRG3Q9Y2Y8 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRG3Q9Y2Y8 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRG3Q9Y2Y8 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRG3Q9Y2Y8 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRG3Q9Y2Y8 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRG3Q9Y2Y8 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRG3Q9Y2Y8 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRG3Q9Y2Y8 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRG3Q9Y2Y8 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRG3Q9Y2Y8 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRG3Q9Y2Y8 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRG3Q9Y2Y8 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRG3Q9Y2Y8 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRG3Q9Y2Y8 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRG3Q9Y2Y8 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRG3Q9Y2Y8 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRG3Q9Y2Y8 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRG3Q9Y2Y8 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRG3Q9Y2Y8 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRG3Q9Y2Y8 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PRG3Q9Y2Y8 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PRG3Q9Y2Y8 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRG3Q9Y2Y8 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRG3Q9Y2Y8 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRG3Q9Y2Y8 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRG3Q9Y2Y8 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRG3Q9Y2Y8 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRG3Q9Y2Y8 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRG3Q9Y2Y8 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRG3Q9Y2Y8 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRG3Q9Y2Y8 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRG3Q9Y2Y8 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRG3Q9Y2Y8 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRG3Q9Y2Y8 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRG3Q9Y2Y8 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRG3Q9Y2Y8 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRG3Q9Y2Y8 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRG3Q9Y2Y8 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRG3Q9Y2Y8 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PRG3Q9Y2Y8 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PRG3Q9Y2Y8 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRG3Q9Y2Y8 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PRG3Q9Y2Y8 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRG3Q9Y2Y8 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRG3Q9Y2Y8 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PRG3Q9Y2Y8 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRG3Q9Y2Y8 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRG3Q9Y2Y8 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRG3Q9Y2Y8 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRG3Q9Y2Y8 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRG3Q9Y2Y8 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRG3Q9Y2Y8 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PRG3Q9Y2Y8 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRG3Q9Y2Y8 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRG3Q9Y2Y8 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRG3Q9Y2Y8 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRG3Q9Y2Y8 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRG3Q9Y2Y8 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRG3Q9Y2Y8 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PRG3Q9Y2Y8 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PRG3Q9Y2Y8 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRG3Q9Y2Y8 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PRG3Q9Y2Y8 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRG3Q9Y2Y8 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRG3Q9Y2Y8 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PRG3Q9Y2Y8 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRG3Q9Y2Y8 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRG3Q9Y2Y8 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRG3Q9Y2Y8 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PRG3Q9Y2Y8 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PRG3Q9Y2Y8 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PRG3Q9Y2Y8 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRG3Q9Y2Y8 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRG3Q9Y2Y8 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRG3Q9Y2Y8 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRG3Q9Y2Y8 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PRG3Q9Y2Y8 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRG3Q9Y2Y8 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRG3Q9Y2Y8 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms