Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2I1

NISCH, Nischarin, humanhuman

Predictions only

Length 1,504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCHQ9Y2I1 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC48.23■■■■■ 5.31
NISCHQ9Y2I1 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC48.23■■■■■ 5.31
NISCHQ9Y2I1 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC48.23■■■■■ 5.31
NISCHQ9Y2I1 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.23■■■■■ 5.31
NISCHQ9Y2I1 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC48.23■■■■■ 5.31
NISCHQ9Y2I1 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC48.22■■■■■ 5.31
NISCHQ9Y2I1 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC48.22■■■■■ 5.31
NISCHQ9Y2I1 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC48.22■■■■■ 5.31
NISCHQ9Y2I1 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC48.22■■■■■ 5.31
NISCHQ9Y2I1 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC48.22■■■■■ 5.31
NISCHQ9Y2I1 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC48.22■■■■■ 5.31
NISCHQ9Y2I1 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC48.22■■■■■ 5.31
NISCHQ9Y2I1 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC48.22■■■■■ 5.31
NISCHQ9Y2I1 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.21■■■■■ 5.31
NISCHQ9Y2I1 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC48.21■■■■■ 5.31
NISCHQ9Y2I1 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.21■■■■■ 5.31
NISCHQ9Y2I1 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC48.21■■■■■ 5.31
NISCHQ9Y2I1 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC48.21■■■■■ 5.31
NISCHQ9Y2I1 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC48.21■■■■■ 5.31
NISCHQ9Y2I1 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC48.2■■■■■ 5.31
NISCHQ9Y2I1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC48.2■■■■■ 5.31
NISCHQ9Y2I1 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC48.2■■■■■ 5.31
NISCHQ9Y2I1 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC48.2■■■■■ 5.31
NISCHQ9Y2I1 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.2■■■■■ 5.31
NISCHQ9Y2I1 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC48.2■■■■■ 5.31
NISCHQ9Y2I1 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC48.2■■■■■ 5.31
NISCHQ9Y2I1 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC48.2■■■■■ 5.31
NISCHQ9Y2I1 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC48.2■■■■■ 5.31
NISCHQ9Y2I1 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC48.2■■■■■ 5.31
NISCHQ9Y2I1 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC48.2■■■■■ 5.31
NISCHQ9Y2I1 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC48.19■■■■■ 5.31
NISCHQ9Y2I1 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC48.19■■■■■ 5.31
NISCHQ9Y2I1 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC48.19■■■■■ 5.31
NISCHQ9Y2I1 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC48.19■■■■■ 5.3
NISCHQ9Y2I1 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.19■■■■■ 5.3
NISCHQ9Y2I1 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC48.18■■■■■ 5.3
NISCHQ9Y2I1 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.18■■■■■ 5.3
NISCHQ9Y2I1 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.18■■■■■ 5.3
NISCHQ9Y2I1 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC48.18■■■■■ 5.3
NISCHQ9Y2I1 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.18■■■■■ 5.3
NISCHQ9Y2I1 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC48.18■■■■■ 5.3
NISCHQ9Y2I1 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC48.18■■■■■ 5.3
NISCHQ9Y2I1 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC48.18■■■■■ 5.3
NISCHQ9Y2I1 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC48.18■■■■■ 5.3
NISCHQ9Y2I1 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC48.17■■■■■ 5.3
NISCHQ9Y2I1 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.17■■■■■ 5.3
NISCHQ9Y2I1 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC48.17■■■■■ 5.3
NISCHQ9Y2I1 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC48.17■■■■■ 5.3
NISCHQ9Y2I1 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC48.17■■■■■ 5.3
NISCHQ9Y2I1 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.16■■■■■ 5.3
NISCHQ9Y2I1 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.16■■■■■ 5.3
NISCHQ9Y2I1 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC48.16■■■■■ 5.3
NISCHQ9Y2I1 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC48.15■■■■■ 5.3
NISCHQ9Y2I1 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.15■■■■■ 5.3
NISCHQ9Y2I1 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC48.15■■■■■ 5.3
NISCHQ9Y2I1 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC48.15■■■■■ 5.3
NISCHQ9Y2I1 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC48.15■■■■■ 5.3
NISCHQ9Y2I1 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.15■■■■■ 5.3
NISCHQ9Y2I1 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC48.15■■■■■ 5.3
NISCHQ9Y2I1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.14■■■■■ 5.3
NISCHQ9Y2I1 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.14■■■■■ 5.3
NISCHQ9Y2I1 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC48.14■■■■■ 5.3
NISCHQ9Y2I1 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC48.13■■■■■ 5.3
NISCHQ9Y2I1 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC48.13■■■■■ 5.3
NISCHQ9Y2I1 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC48.13■■■■■ 5.3
NISCHQ9Y2I1 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC48.13■■■■■ 5.3
NISCHQ9Y2I1 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC48.13■■■■■ 5.3
NISCHQ9Y2I1 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.13■■■■■ 5.3
NISCHQ9Y2I1 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC48.13■■■■■ 5.3
NISCHQ9Y2I1 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC48.13■■■■■ 5.3
NISCHQ9Y2I1 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC48.13■■■■■ 5.3
NISCHQ9Y2I1 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC48.13■■■■■ 5.3
NISCHQ9Y2I1 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.13■■■■■ 5.29
NISCHQ9Y2I1 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC48.13■■■■■ 5.29
NISCHQ9Y2I1 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC48.12■■■■■ 5.29
NISCHQ9Y2I1 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC48.12■■■■■ 5.29
NISCHQ9Y2I1 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC48.12■■■■■ 5.29
NISCHQ9Y2I1 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC48.12■■■■■ 5.29
NISCHQ9Y2I1 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC48.12■■■■■ 5.29
NISCHQ9Y2I1 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC48.12■■■■■ 5.29
NISCHQ9Y2I1 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC48.12■■■■■ 5.29
NISCHQ9Y2I1 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC48.11■■■■■ 5.29
NISCHQ9Y2I1 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC48.11■■■■■ 5.29
NISCHQ9Y2I1 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC48.11■■■■■ 5.29
NISCHQ9Y2I1 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC48.11■■■■■ 5.29
NISCHQ9Y2I1 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC48.11■■■■■ 5.29
NISCHQ9Y2I1 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC48.11■■■■■ 5.29
NISCHQ9Y2I1 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.1■■■■■ 5.29
NISCHQ9Y2I1 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.1■■■■■ 5.29
NISCHQ9Y2I1 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC48.1■■■■■ 5.29
NISCHQ9Y2I1 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC48.1■■■■■ 5.29
NISCHQ9Y2I1 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.1■■■■■ 5.29
NISCHQ9Y2I1 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC48.09■■■■■ 5.29
NISCHQ9Y2I1 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC48.09■■■■■ 5.29
NISCHQ9Y2I1 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.09■■■■■ 5.29
NISCHQ9Y2I1 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.09■■■■■ 5.29
NISCHQ9Y2I1 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.09■■■■■ 5.29
NISCHQ9Y2I1 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC48.09■■■■■ 5.29
NISCHQ9Y2I1 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC48.09■■■■■ 5.29
NISCHQ9Y2I1 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC48.09■■■■■ 5.29
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