Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y248

GINS2, DNA replication complex GINS protein PSF2, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS2Q9Y248 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GINS2Q9Y248 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GINS2Q9Y248 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GINS2Q9Y248 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GINS2Q9Y248 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GINS2Q9Y248 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GINS2Q9Y248 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GINS2Q9Y248 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GINS2Q9Y248 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GINS2Q9Y248 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GINS2Q9Y248 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GINS2Q9Y248 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GINS2Q9Y248 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GINS2Q9Y248 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GINS2Q9Y248 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GINS2Q9Y248 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GINS2Q9Y248 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GINS2Q9Y248 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GINS2Q9Y248 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GINS2Q9Y248 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GINS2Q9Y248 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GINS2Q9Y248 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GINS2Q9Y248 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GINS2Q9Y248 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GINS2Q9Y248 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GINS2Q9Y248 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GINS2Q9Y248 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GINS2Q9Y248 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GINS2Q9Y248 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GINS2Q9Y248 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GINS2Q9Y248 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
GINS2Q9Y248 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GINS2Q9Y248 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GINS2Q9Y248 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GINS2Q9Y248 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GINS2Q9Y248 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
GINS2Q9Y248 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GINS2Q9Y248 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GINS2Q9Y248 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GINS2Q9Y248 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GINS2Q9Y248 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GINS2Q9Y248 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GINS2Q9Y248 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GINS2Q9Y248 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GINS2Q9Y248 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GINS2Q9Y248 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GINS2Q9Y248 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GINS2Q9Y248 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GINS2Q9Y248 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GINS2Q9Y248 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GINS2Q9Y248 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GINS2Q9Y248 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GINS2Q9Y248 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GINS2Q9Y248 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GINS2Q9Y248 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GINS2Q9Y248 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GINS2Q9Y248 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GINS2Q9Y248 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GINS2Q9Y248 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GINS2Q9Y248 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GINS2Q9Y248 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GINS2Q9Y248 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GINS2Q9Y248 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GINS2Q9Y248 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GINS2Q9Y248 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
GINS2Q9Y248 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GINS2Q9Y248 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GINS2Q9Y248 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GINS2Q9Y248 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GINS2Q9Y248 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GINS2Q9Y248 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GINS2Q9Y248 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GINS2Q9Y248 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GINS2Q9Y248 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GINS2Q9Y248 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GINS2Q9Y248 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GINS2Q9Y248 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GINS2Q9Y248 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GINS2Q9Y248 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GINS2Q9Y248 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GINS2Q9Y248 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
GINS2Q9Y248 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GINS2Q9Y248 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GINS2Q9Y248 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GINS2Q9Y248 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GINS2Q9Y248 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GINS2Q9Y248 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GINS2Q9Y248 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GINS2Q9Y248 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GINS2Q9Y248 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GINS2Q9Y248 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GINS2Q9Y248 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GINS2Q9Y248 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
GINS2Q9Y248 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GINS2Q9Y248 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GINS2Q9Y248 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GINS2Q9Y248 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GINS2Q9Y248 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GINS2Q9Y248 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GINS2Q9Y248 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms