Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y239

NOD1, Nucleotide-binding oligomerization domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOD1Q9Y239 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NOD1Q9Y239 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NOD1Q9Y239 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NOD1Q9Y239 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NOD1Q9Y239 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NOD1Q9Y239 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NOD1Q9Y239 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NOD1Q9Y239 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NOD1Q9Y239 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NOD1Q9Y239 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NOD1Q9Y239 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NOD1Q9Y239 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NOD1Q9Y239 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NOD1Q9Y239 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NOD1Q9Y239 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NOD1Q9Y239 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NOD1Q9Y239 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NOD1Q9Y239 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NOD1Q9Y239 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NOD1Q9Y239 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NOD1Q9Y239 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NOD1Q9Y239 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NOD1Q9Y239 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NOD1Q9Y239 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NOD1Q9Y239 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NOD1Q9Y239 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NOD1Q9Y239 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NOD1Q9Y239 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NOD1Q9Y239 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NOD1Q9Y239 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NOD1Q9Y239 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NOD1Q9Y239 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NOD1Q9Y239 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NOD1Q9Y239 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NOD1Q9Y239 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NOD1Q9Y239 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NOD1Q9Y239 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NOD1Q9Y239 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NOD1Q9Y239 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NOD1Q9Y239 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NOD1Q9Y239 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NOD1Q9Y239 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NOD1Q9Y239 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NOD1Q9Y239 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NOD1Q9Y239 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NOD1Q9Y239 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NOD1Q9Y239 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NOD1Q9Y239 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NOD1Q9Y239 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NOD1Q9Y239 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NOD1Q9Y239 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NOD1Q9Y239 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NOD1Q9Y239 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NOD1Q9Y239 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NOD1Q9Y239 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NOD1Q9Y239 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NOD1Q9Y239 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NOD1Q9Y239 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NOD1Q9Y239 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NOD1Q9Y239 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NOD1Q9Y239 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NOD1Q9Y239 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NOD1Q9Y239 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NOD1Q9Y239 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NOD1Q9Y239 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
NOD1Q9Y239 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NOD1Q9Y239 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NOD1Q9Y239 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NOD1Q9Y239 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NOD1Q9Y239 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NOD1Q9Y239 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NOD1Q9Y239 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NOD1Q9Y239 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NOD1Q9Y239 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NOD1Q9Y239 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NOD1Q9Y239 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NOD1Q9Y239 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NOD1Q9Y239 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NOD1Q9Y239 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NOD1Q9Y239 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NOD1Q9Y239 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NOD1Q9Y239 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NOD1Q9Y239 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NOD1Q9Y239 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NOD1Q9Y239 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NOD1Q9Y239 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NOD1Q9Y239 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NOD1Q9Y239 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NOD1Q9Y239 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NOD1Q9Y239 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NOD1Q9Y239 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NOD1Q9Y239 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NOD1Q9Y239 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NOD1Q9Y239 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NOD1Q9Y239 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NOD1Q9Y239 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NOD1Q9Y239 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NOD1Q9Y239 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NOD1Q9Y239 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NOD1Q9Y239 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms