Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQE7

SMC3, Structural maintenance of chromosomes protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC3Q9UQE7 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMC3Q9UQE7 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMC3Q9UQE7 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SMC3Q9UQE7 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMC3Q9UQE7 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMC3Q9UQE7 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SMC3Q9UQE7 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMC3Q9UQE7 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMC3Q9UQE7 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMC3Q9UQE7 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMC3Q9UQE7 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMC3Q9UQE7 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMC3Q9UQE7 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMC3Q9UQE7 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMC3Q9UQE7 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMC3Q9UQE7 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMC3Q9UQE7 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMC3Q9UQE7 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SMC3Q9UQE7 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMC3Q9UQE7 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMC3Q9UQE7 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMC3Q9UQE7 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMC3Q9UQE7 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMC3Q9UQE7 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMC3Q9UQE7 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMC3Q9UQE7 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMC3Q9UQE7 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMC3Q9UQE7 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMC3Q9UQE7 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMC3Q9UQE7 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMC3Q9UQE7 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMC3Q9UQE7 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMC3Q9UQE7 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMC3Q9UQE7 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMC3Q9UQE7 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMC3Q9UQE7 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMC3Q9UQE7 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMC3Q9UQE7 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMC3Q9UQE7 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SMC3Q9UQE7 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMC3Q9UQE7 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMC3Q9UQE7 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMC3Q9UQE7 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMC3Q9UQE7 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMC3Q9UQE7 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMC3Q9UQE7 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMC3Q9UQE7 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMC3Q9UQE7 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMC3Q9UQE7 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SMC3Q9UQE7 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMC3Q9UQE7 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMC3Q9UQE7 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMC3Q9UQE7 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMC3Q9UQE7 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMC3Q9UQE7 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMC3Q9UQE7 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMC3Q9UQE7 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMC3Q9UQE7 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMC3Q9UQE7 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMC3Q9UQE7 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMC3Q9UQE7 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMC3Q9UQE7 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMC3Q9UQE7 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SMC3Q9UQE7 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMC3Q9UQE7 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMC3Q9UQE7 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMC3Q9UQE7 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMC3Q9UQE7 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SMC3Q9UQE7 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SMC3Q9UQE7 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SMC3Q9UQE7 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMC3Q9UQE7 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMC3Q9UQE7 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMC3Q9UQE7 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SMC3Q9UQE7 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMC3Q9UQE7 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMC3Q9UQE7 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SMC3Q9UQE7 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMC3Q9UQE7 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMC3Q9UQE7 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SMC3Q9UQE7 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMC3Q9UQE7 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMC3Q9UQE7 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMC3Q9UQE7 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMC3Q9UQE7 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMC3Q9UQE7 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMC3Q9UQE7 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMC3Q9UQE7 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMC3Q9UQE7 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMC3Q9UQE7 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMC3Q9UQE7 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMC3Q9UQE7 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMC3Q9UQE7 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMC3Q9UQE7 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMC3Q9UQE7 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMC3Q9UQE7 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMC3Q9UQE7 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMC3Q9UQE7 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMC3Q9UQE7 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMC3Q9UQE7 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms