Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

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Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SHOC2Q9UQ13 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SHOC2Q9UQ13 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SHOC2Q9UQ13 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SHOC2Q9UQ13 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SHOC2Q9UQ13 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SHOC2Q9UQ13 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SHOC2Q9UQ13 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SHOC2Q9UQ13 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SHOC2Q9UQ13 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SHOC2Q9UQ13 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SHOC2Q9UQ13 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SHOC2Q9UQ13 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SHOC2Q9UQ13 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SHOC2Q9UQ13 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SHOC2Q9UQ13 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SHOC2Q9UQ13 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SHOC2Q9UQ13 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SHOC2Q9UQ13 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SHOC2Q9UQ13 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SHOC2Q9UQ13 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SHOC2Q9UQ13 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SHOC2Q9UQ13 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SHOC2Q9UQ13 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SHOC2Q9UQ13 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SHOC2Q9UQ13 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SHOC2Q9UQ13 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SHOC2Q9UQ13 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SHOC2Q9UQ13 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SHOC2Q9UQ13 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SHOC2Q9UQ13 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SHOC2Q9UQ13 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SHOC2Q9UQ13 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SHOC2Q9UQ13 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SHOC2Q9UQ13 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SHOC2Q9UQ13 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SHOC2Q9UQ13 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SHOC2Q9UQ13 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SHOC2Q9UQ13 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SHOC2Q9UQ13 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SHOC2Q9UQ13 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SHOC2Q9UQ13 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SHOC2Q9UQ13 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SHOC2Q9UQ13 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SHOC2Q9UQ13 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SHOC2Q9UQ13 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SHOC2Q9UQ13 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SHOC2Q9UQ13 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SHOC2Q9UQ13 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SHOC2Q9UQ13 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SHOC2Q9UQ13 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SHOC2Q9UQ13 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SHOC2Q9UQ13 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SHOC2Q9UQ13 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SHOC2Q9UQ13 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SHOC2Q9UQ13 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SHOC2Q9UQ13 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SHOC2Q9UQ13 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SHOC2Q9UQ13 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SHOC2Q9UQ13 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SHOC2Q9UQ13 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SHOC2Q9UQ13 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SHOC2Q9UQ13 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SHOC2Q9UQ13 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SHOC2Q9UQ13 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SHOC2Q9UQ13 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SHOC2Q9UQ13 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SHOC2Q9UQ13 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SHOC2Q9UQ13 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SHOC2Q9UQ13 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SHOC2Q9UQ13 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SHOC2Q9UQ13 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SHOC2Q9UQ13 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SHOC2Q9UQ13 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SHOC2Q9UQ13 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SHOC2Q9UQ13 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SHOC2Q9UQ13 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SHOC2Q9UQ13 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SHOC2Q9UQ13 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SHOC2Q9UQ13 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SHOC2Q9UQ13 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SHOC2Q9UQ13 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SHOC2Q9UQ13 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SHOC2Q9UQ13 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SHOC2Q9UQ13 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SHOC2Q9UQ13 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SHOC2Q9UQ13 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SHOC2Q9UQ13 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SHOC2Q9UQ13 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SHOC2Q9UQ13 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SHOC2Q9UQ13 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SHOC2Q9UQ13 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SHOC2Q9UQ13 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SHOC2Q9UQ13 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SHOC2Q9UQ13 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SHOC2Q9UQ13 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SHOC2Q9UQ13 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SHOC2Q9UQ13 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SHOC2Q9UQ13 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SHOC2Q9UQ13 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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