Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNG2

TNFSF18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF18Q9UNG2 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNFSF18Q9UNG2 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNFSF18Q9UNG2 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNFSF18Q9UNG2 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNFSF18Q9UNG2 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNFSF18Q9UNG2 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNFSF18Q9UNG2 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNFSF18Q9UNG2 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNFSF18Q9UNG2 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNFSF18Q9UNG2 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNFSF18Q9UNG2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TNFSF18Q9UNG2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNFSF18Q9UNG2 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNFSF18Q9UNG2 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNFSF18Q9UNG2 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNFSF18Q9UNG2 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNFSF18Q9UNG2 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNFSF18Q9UNG2 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNFSF18Q9UNG2 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNFSF18Q9UNG2 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNFSF18Q9UNG2 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNFSF18Q9UNG2 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNFSF18Q9UNG2 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNFSF18Q9UNG2 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNFSF18Q9UNG2 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
TNFSF18Q9UNG2 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
TNFSF18Q9UNG2 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
TNFSF18Q9UNG2 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
TNFSF18Q9UNG2 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
TNFSF18Q9UNG2 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
TNFSF18Q9UNG2 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TNFSF18Q9UNG2 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TNFSF18Q9UNG2 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TNFSF18Q9UNG2 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TNFSF18Q9UNG2 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TNFSF18Q9UNG2 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TNFSF18Q9UNG2 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TNFSF18Q9UNG2 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TNFSF18Q9UNG2 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TNFSF18Q9UNG2 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TNFSF18Q9UNG2 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TNFSF18Q9UNG2 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TNFSF18Q9UNG2 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TNFSF18Q9UNG2 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TNFSF18Q9UNG2 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TNFSF18Q9UNG2 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TNFSF18Q9UNG2 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TNFSF18Q9UNG2 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TNFSF18Q9UNG2 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TNFSF18Q9UNG2 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TNFSF18Q9UNG2 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TNFSF18Q9UNG2 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TNFSF18Q9UNG2 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TNFSF18Q9UNG2 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TNFSF18Q9UNG2 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TNFSF18Q9UNG2 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TNFSF18Q9UNG2 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TNFSF18Q9UNG2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TNFSF18Q9UNG2 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TNFSF18Q9UNG2 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TNFSF18Q9UNG2 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TNFSF18Q9UNG2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
TNFSF18Q9UNG2 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TNFSF18Q9UNG2 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TNFSF18Q9UNG2 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TNFSF18Q9UNG2 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TNFSF18Q9UNG2 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TNFSF18Q9UNG2 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TNFSF18Q9UNG2 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TNFSF18Q9UNG2 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TNFSF18Q9UNG2 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TNFSF18Q9UNG2 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TNFSF18Q9UNG2 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TNFSF18Q9UNG2 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TNFSF18Q9UNG2 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TNFSF18Q9UNG2 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TNFSF18Q9UNG2 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TNFSF18Q9UNG2 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TNFSF18Q9UNG2 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TNFSF18Q9UNG2 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TNFSF18Q9UNG2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TNFSF18Q9UNG2 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
TNFSF18Q9UNG2 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TNFSF18Q9UNG2 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TNFSF18Q9UNG2 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TNFSF18Q9UNG2 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TNFSF18Q9UNG2 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TNFSF18Q9UNG2 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TNFSF18Q9UNG2 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TNFSF18Q9UNG2 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TNFSF18Q9UNG2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TNFSF18Q9UNG2 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TNFSF18Q9UNG2 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TNFSF18Q9UNG2 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TNFSF18Q9UNG2 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TNFSF18Q9UNG2 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TNFSF18Q9UNG2 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TNFSF18Q9UNG2 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TNFSF18Q9UNG2 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TNFSF18Q9UNG2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms