Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNF0

PACSIN2, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN2Q9UNF0 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PACSIN2Q9UNF0 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PACSIN2Q9UNF0 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PACSIN2Q9UNF0 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PACSIN2Q9UNF0 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PACSIN2Q9UNF0 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PACSIN2Q9UNF0 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PACSIN2Q9UNF0 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PACSIN2Q9UNF0 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PACSIN2Q9UNF0 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PACSIN2Q9UNF0 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PACSIN2Q9UNF0 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PACSIN2Q9UNF0 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PACSIN2Q9UNF0 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PACSIN2Q9UNF0 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PACSIN2Q9UNF0 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PACSIN2Q9UNF0 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PACSIN2Q9UNF0 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PACSIN2Q9UNF0 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PACSIN2Q9UNF0 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PACSIN2Q9UNF0 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PACSIN2Q9UNF0 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PACSIN2Q9UNF0 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PACSIN2Q9UNF0 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PACSIN2Q9UNF0 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PACSIN2Q9UNF0 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PACSIN2Q9UNF0 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
PACSIN2Q9UNF0 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
PACSIN2Q9UNF0 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PACSIN2Q9UNF0 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PACSIN2Q9UNF0 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PACSIN2Q9UNF0 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PACSIN2Q9UNF0 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PACSIN2Q9UNF0 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PACSIN2Q9UNF0 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PACSIN2Q9UNF0 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PACSIN2Q9UNF0 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PACSIN2Q9UNF0 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PACSIN2Q9UNF0 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PACSIN2Q9UNF0 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PACSIN2Q9UNF0 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PACSIN2Q9UNF0 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PACSIN2Q9UNF0 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PACSIN2Q9UNF0 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PACSIN2Q9UNF0 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PACSIN2Q9UNF0 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PACSIN2Q9UNF0 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PACSIN2Q9UNF0 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PACSIN2Q9UNF0 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PACSIN2Q9UNF0 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PACSIN2Q9UNF0 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PACSIN2Q9UNF0 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PACSIN2Q9UNF0 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PACSIN2Q9UNF0 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PACSIN2Q9UNF0 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PACSIN2Q9UNF0 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PACSIN2Q9UNF0 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PACSIN2Q9UNF0 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PACSIN2Q9UNF0 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PACSIN2Q9UNF0 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PACSIN2Q9UNF0 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PACSIN2Q9UNF0 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PACSIN2Q9UNF0 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PACSIN2Q9UNF0 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PACSIN2Q9UNF0 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PACSIN2Q9UNF0 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PACSIN2Q9UNF0 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PACSIN2Q9UNF0 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PACSIN2Q9UNF0 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PACSIN2Q9UNF0 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PACSIN2Q9UNF0 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PACSIN2Q9UNF0 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PACSIN2Q9UNF0 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PACSIN2Q9UNF0 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PACSIN2Q9UNF0 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PACSIN2Q9UNF0 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PACSIN2Q9UNF0 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PACSIN2Q9UNF0 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PACSIN2Q9UNF0 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PACSIN2Q9UNF0 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PACSIN2Q9UNF0 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PACSIN2Q9UNF0 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PACSIN2Q9UNF0 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PACSIN2Q9UNF0 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PACSIN2Q9UNF0 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PACSIN2Q9UNF0 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PACSIN2Q9UNF0 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PACSIN2Q9UNF0 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PACSIN2Q9UNF0 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PACSIN2Q9UNF0 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PACSIN2Q9UNF0 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PACSIN2Q9UNF0 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PACSIN2Q9UNF0 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PACSIN2Q9UNF0 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PACSIN2Q9UNF0 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PACSIN2Q9UNF0 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PACSIN2Q9UNF0 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PACSIN2Q9UNF0 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PACSIN2Q9UNF0 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PACSIN2Q9UNF0 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms