Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK5

VANGL2, Vang-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VANGL2Q9ULK5 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.32■■□□□ 1
VANGL2Q9ULK5 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
VANGL2Q9ULK5 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.32■■□□□ 1
VANGL2Q9ULK5 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.32■■□□□ 1
VANGL2Q9ULK5 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.32■■□□□ 1
VANGL2Q9ULK5 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VANGL2Q9ULK5 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.32■■□□□ 1
VANGL2Q9ULK5 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
VANGL2Q9ULK5 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
VANGL2Q9ULK5 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VANGL2Q9ULK5 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
VANGL2Q9ULK5 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
VANGL2Q9ULK5 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VANGL2Q9ULK5 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
VANGL2Q9ULK5 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VANGL2Q9ULK5 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
VANGL2Q9ULK5 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VANGL2Q9ULK5 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VANGL2Q9ULK5 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VANGL2Q9ULK5 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VANGL2Q9ULK5 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
VANGL2Q9ULK5 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.31■■□□□ 1
VANGL2Q9ULK5 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
VANGL2Q9ULK5 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
VANGL2Q9ULK5 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
VANGL2Q9ULK5 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.31■■□□□ 1
VANGL2Q9ULK5 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
VANGL2Q9ULK5 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
VANGL2Q9ULK5 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VANGL2Q9ULK5 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VANGL2Q9ULK5 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
VANGL2Q9ULK5 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VANGL2Q9ULK5 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VANGL2Q9ULK5 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VANGL2Q9ULK5 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
VANGL2Q9ULK5 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
VANGL2Q9ULK5 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.3■■□□□ 1
VANGL2Q9ULK5 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VANGL2Q9ULK5 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
VANGL2Q9ULK5 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VANGL2Q9ULK5 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VANGL2Q9ULK5 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VANGL2Q9ULK5 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VANGL2Q9ULK5 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VANGL2Q9ULK5 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VANGL2Q9ULK5 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VANGL2Q9ULK5 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VANGL2Q9ULK5 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VANGL2Q9ULK5 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
VANGL2Q9ULK5 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VANGL2Q9ULK5 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.29■■□□□ 1
VANGL2Q9ULK5 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VANGL2Q9ULK5 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
VANGL2Q9ULK5 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VANGL2Q9ULK5 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
VANGL2Q9ULK5 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VANGL2Q9ULK5 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VANGL2Q9ULK5 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
VANGL2Q9ULK5 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VANGL2Q9ULK5 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
VANGL2Q9ULK5 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VANGL2Q9ULK5 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
VANGL2Q9ULK5 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
VANGL2Q9ULK5 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VANGL2Q9ULK5 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.28■■□□□ 1
VANGL2Q9ULK5 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
VANGL2Q9ULK5 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
VANGL2Q9ULK5 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
VANGL2Q9ULK5 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VANGL2Q9ULK5 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VANGL2Q9ULK5 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VANGL2Q9ULK5 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VANGL2Q9ULK5 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VANGL2Q9ULK5 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VANGL2Q9ULK5 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VANGL2Q9ULK5 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
VANGL2Q9ULK5 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
VANGL2Q9ULK5 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.27■■□□□ 1
VANGL2Q9ULK5 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
VANGL2Q9ULK5 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.27■■□□□ 1
VANGL2Q9ULK5 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
VANGL2Q9ULK5 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
VANGL2Q9ULK5 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
VANGL2Q9ULK5 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VANGL2Q9ULK5 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VANGL2Q9ULK5 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VANGL2Q9ULK5 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
VANGL2Q9ULK5 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
VANGL2Q9ULK5 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
VANGL2Q9ULK5 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VANGL2Q9ULK5 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VANGL2Q9ULK5 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VANGL2Q9ULK5 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VANGL2Q9ULK5 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VANGL2Q9ULK5 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VANGL2Q9ULK5 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VANGL2Q9ULK5 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
VANGL2Q9ULK5 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VANGL2Q9ULK5 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VANGL2Q9ULK5 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms