Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK4

MED23, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 23, humanhuman

Predictions only

Length 1,368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED23Q9ULK4 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MED23Q9ULK4 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
MED23Q9ULK4 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
MED23Q9ULK4 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MED23Q9ULK4 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MED23Q9ULK4 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MED23Q9ULK4 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MED23Q9ULK4 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MED23Q9ULK4 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MED23Q9ULK4 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MED23Q9ULK4 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MED23Q9ULK4 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MED23Q9ULK4 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MED23Q9ULK4 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MED23Q9ULK4 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
MED23Q9ULK4 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MED23Q9ULK4 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MED23Q9ULK4 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MED23Q9ULK4 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MED23Q9ULK4 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MED23Q9ULK4 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MED23Q9ULK4 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MED23Q9ULK4 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MED23Q9ULK4 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MED23Q9ULK4 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MED23Q9ULK4 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
MED23Q9ULK4 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MED23Q9ULK4 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MED23Q9ULK4 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MED23Q9ULK4 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MED23Q9ULK4 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MED23Q9ULK4 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MED23Q9ULK4 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MED23Q9ULK4 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MED23Q9ULK4 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MED23Q9ULK4 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
MED23Q9ULK4 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MED23Q9ULK4 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MED23Q9ULK4 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MED23Q9ULK4 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MED23Q9ULK4 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MED23Q9ULK4 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MED23Q9ULK4 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MED23Q9ULK4 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MED23Q9ULK4 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MED23Q9ULK4 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MED23Q9ULK4 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MED23Q9ULK4 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MED23Q9ULK4 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MED23Q9ULK4 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MED23Q9ULK4 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MED23Q9ULK4 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MED23Q9ULK4 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MED23Q9ULK4 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MED23Q9ULK4 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MED23Q9ULK4 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MED23Q9ULK4 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MED23Q9ULK4 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MED23Q9ULK4 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MED23Q9ULK4 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MED23Q9ULK4 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MED23Q9ULK4 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MED23Q9ULK4 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MED23Q9ULK4 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MED23Q9ULK4 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MED23Q9ULK4 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MED23Q9ULK4 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MED23Q9ULK4 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MED23Q9ULK4 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MED23Q9ULK4 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MED23Q9ULK4 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MED23Q9ULK4 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MED23Q9ULK4 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MED23Q9ULK4 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MED23Q9ULK4 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MED23Q9ULK4 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MED23Q9ULK4 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MED23Q9ULK4 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
MED23Q9ULK4 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MED23Q9ULK4 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
MED23Q9ULK4 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MED23Q9ULK4 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MED23Q9ULK4 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MED23Q9ULK4 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MED23Q9ULK4 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MED23Q9ULK4 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
MED23Q9ULK4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MED23Q9ULK4 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
MED23Q9ULK4 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MED23Q9ULK4 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MED23Q9ULK4 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MED23Q9ULK4 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MED23Q9ULK4 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MED23Q9ULK4 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MED23Q9ULK4 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MED23Q9ULK4 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MED23Q9ULK4 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MED23Q9ULK4 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MED23Q9ULK4 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MED23Q9ULK4 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms